Znana ze swojej bioróżnorodności Malezja jest domem dla 15 000 kwitnących roślin. Jednak flora i fauna kraju są poważnie zagrożone i doświadczyły 70-procentowego wyczerpania pierwotnego wzrostu. Według Czerwonej Księgi Międzynarodowej Unii Ochrony Przyrody (IUCN), Malezja ma 686 zagrożonych gatunków roślin od 2007 roku. Malezyjskie przepisy chronią ptaki, ssaki i owady. Flora i fauna są chronione tylko wtedy, gdy rosną na terenie parku narodowego lub rezerwatu.
Według Worldwide Wildlife Fund, główne typy lasów w Malezji to Giam Kanching lub rzadki las dipterocarp, las namorzynowy, las bagienny i las wrzosowy. Drzewo dipterocarp, znane z owoców o dwuskrzydłych nasionach, rośnie na lądzie tuż nad poziomem morza na wysokości około 900 metrów. Nizinne lasy dipterocarp, które znajdują się do 300 metrów nad poziomem morza, zostały zdziesiątkowane z powodu rolnictwa i innych intensywnych działań. Chociaż skupisko drzew dipterocarp jest chronione w Rezerwacie Lasu Kanching, gatunek ten jest uważany za krytycznie zagrożony – na skraju wyginięcia – na Czerwonej Liście.
Ta mięsożerna roślina tropikalna rośnie tylko w omszałych lasach na wysokości od 2000 do 2600 metrów na górze Trus Madi na Borneo. Nepenthes macrophylla ma liście w kształcie dzbanka, które zwisają z dziesięciometrowych winorośli. Zgodnie z ASEAN Review of Biodiversity & Environmental Conservation, owady ześlizgują się z woskowej górnej części kwiatu do kałuży kwasu wydzielanego przez gruczoły w dolnej części kwiatu. Czerwona lista IUCN sklasyfikowała makrofilię Nepenthes jako krytycznie zagrożoną.
Uważany za krytycznie zagrożony na Czerwonej Liście, Taxitheliella richardsii jest mchem z rodziny Sematophyllaceae i pochodzi z Malezji. Jedyny znany obszar (mniej niż 10 km²), na którym znaleziono mech, znajduje się w Sarawak, malezyjskim stanie na północno-zachodnim Borneo. Taxitheliella richardsii rośnie na zdrewniałych winoroślach i gnijących kłodach w lasach podzwrotnikowych, siedlisku, które zanika z powodu pozyskiwania i wyrębu drewna.
