Bardzo niewiele bakterii wytwarza endospory. Tylko niektóre z tych gatunków z rodzaju Firmicute wytwarzają endospory, które są strukturami niereprodukcyjnymi zawierającymi DNA i część cytoplazmy. Endospory nie są prawdziwymi zarodnikami, ponieważ nie są potomstwem bakterii. Endospory powstają, gdy bakterie są poddawane ekstremalnym lub niekorzystnym warunkom środowiskowym. Mogą przetrwać przez długi czas, nawet gdy są pozbawione pożywienia i wystawione na działanie chemikaliów i temperatur, które normalnie zabijałyby bakterie.
Bakterie Bacillus
Bakterie z rodzaju Bacillus są najczęściej badanymi spośród wszystkich bakterii wytwarzających przetrwalniki. Bakterie Bacillus są różnorodne i rozwijają się w wielu różnych środowiskach. Endospory tej bakterii są wysoce toksyczne dla wielu organizmów, w tym dla ludzi. Patogen Bacillus anthracis jest dobrze znaną toksyną stosowaną zarówno przez naukowców, jak i terrorystów. Istnieje jednak wiele innych gatunków Bacillus.
Bakterie Clostridium
Podobnie jak inne gatunki bakterii wytwarzających endospory, bakterie Clostridium są gram-dodatnie, co wskazuje, że mają podobne cechy, takie jak struktura ściany komórkowej. Bakterie Gram-dodatnie są wrażliwe na te same lub blisko spokrewnione antybiotyki. Bakterie z rodzaju Clostridium są odpowiedzialne za szereg chorób człowieka, od łagodnych zatruć pokarmowych po zatrucie jadem kiełbasianym, a także tężec i zgorzel gazową.
Bakterie Desulfotomaculum
Podobnie jak inne bakterie wytwarzające przetrwalniki, bakterie z rodzaju Desulfotomaculum są również odpowiedzialne za psucie się żywności i choroby. Bakterie Desulfotomaculum mogą powodować zepsucie źle konserwowanej żywności. Tam, gdzie jest ich pod dostatkiem, wydzielają nieprzyjemny zapach przypominający siarkę.
