Wat is telling in de microbiologie?

Microbiologie is de studie van micro-organismen: microscopisch kleine of nauwelijks zichtbare eencellige levensvormen zoals bacteriën, archaea, protozoën en sommige schimmels, en zelfs enkele extreem kleine meercellige planten, dieren en schimmels. Microbiologen bestuderen ook levensechte niet-organismische fenomenen zoals virussen, prionen, viroïden en virionen. "Microbe" is een verzamelnaam voor al deze entiteiten. Telling in de microbiologie is de bepaling van het aantal individuele levensvatbare microben in een monster; vier basistechnieken zijn mogelijk.

Een directe maatstaf voor microbiële telling is het standaard aantal platen, ook wel een levensvatbare telling genoemd. Voor deze telling kweek je een monster door het te verdunnen, het op platen met kweekmedium te plaatsen en ze een bepaalde tijd te incuberen. Vervolgens tel je het aantal kolonies en gebruik je dit aantal om het oorspronkelijke aantal microben in het monster af te leiden. Technisch gezien geeft een plaattelling niet het aantal individuele microben, maar eerder van "kolonievormende" eenheden", omdat je niet zeker weet of elke kolonie echt afkomstig is van een enkele microbe of van een kleine groep microben. Deze tellingen worden echter als zeer nauwkeurig beschouwd voor het schatten van het aantal microben in originele monsters. Nadelen zijn dat deze test tijd en ruimte in beslag neemt en gespecialiseerde apparatuur vereist die correct moet worden voorbereid.

Directe microscopische tellingen, ook wel totale celtellingen genoemd, zijn een andere vorm van directe telling. Eerst verdeel je een monster in een aantal even grote kamers. Vervolgens bepaal je het gemiddelde aantal microben per kamer door er een aantal of alle onder een microscoop te tellen. Uiteindelijk gebruik je dit gemiddelde om het getal in de oorspronkelijke eenheid te berekenen. Het belangrijkste nadeel van directe microscopische tellingen is dat het moeilijk is om levende microben van dode te onderscheiden, dus deze methode geeft mogelijk geen nauwkeurige levensvatbare telling.

Troebelheidstesten zijn vormen van indirecte telling. Troebelheid is de troebelheid van een vloeistof. Bij turbidimetrische meting plaatst u een monster in oplossing, meet u de troebelheid van de nieuwe oplossing door er licht doorheen te schijnen met een spectrofotometer, schat dan het aantal levende microben dat nodig is om het waargenomen troebelheidsniveau te produceren. Het nadeel hier is dat iemand al talloze standaard plaattellingen van de microbe in kwestie moet hebben gedaan om monsteroplossingen van verschillende troebelheid te maken, zodat u een standaard heeft om uw huidige monster te meten tegen. U moet ook oppassen dat u uw monster niet te veel concentreert, omdat een turbidimetrische telling alleen nauwkeurig is als er geen microben in het monster andere blokkeren. In een visuele troebelheidsvergelijking vergelijkt u de troebelheid van uw monster met de troebelheid van een eenheid van dezelfde grootte en bekende microbiële telling, en schat u een telling op basis van deze vergelijking.

Twee andere vormen van indirecte telling zijn massabepaling en meting van microbiële activiteit. Voor een massabepalingstelling weeg je de hoeveelheid biologische stof in je monster, vergelijk dit gewicht naar een standaardcurve voor bekende microbiële tellingen en schat hieruit het oorspronkelijke microbiële aantal vergelijking. Voor een microbiële activiteitsmeting meet u de hoeveelheid van een biologisch product in uw monster, zoals: metabolisch afval, vergelijk dit dan met een standaardcurve voor bekende tellingen en schat uw telling hiervan vergelijking.