Klonen is een hot ethische kwestie in de wetenschappelijke gemeenschap, maar bacteriën klonen zichzelf voortdurend. In een proces dat binaire splitsing wordt genoemd, verdubbelt één bacterie zijn grootte en genetisch materiaal, en splitst zich vervolgens om twee identieke cellen te produceren.
In vergelijking met eukaryote celdeling, of mitose, is binaire splitsing een relatief eenvoudig proces. Ten eerste kopieert de bacterie zijn DNA -- genetisch materiaal dat in bacteriën cirkelvormig is. DNA geeft alle informatie die nodig is om een identieke cel te maken. Het DNA wordt vervolgens gescheiden aan tegenovergestelde uiteinden van de cel en eiwitten die nodig zijn voor celdeling worden verzameld in het midden van de cel. De bacterie verdubbelt meestal zijn intracellulaire vloeistof, ook wel cytoplasma genoemd. De eiwitten splitsen de cel in tweeën en bij de meeste bacteriën wordt een nieuwe celwand gebouwd om de deling te voltooien.
Het voordeel van binaire splitsing vanuit het perspectief van bacteriën is dat het snel en eenvoudig is. Vanuit het oogpunt van ziektebestrijding en -preventie is binaire splitsing voordelig omdat het de productie van medicijnen vereenvoudigt. Meestal is er maar één medicijn nodig om een bacteriële infectie te behandelen, omdat alle bacteriën identiek zijn en op dezelfde manier zullen reageren. Helaas ontwikkelen sommige bacteriën echter resistentie tegen geneesmiddelen door mutatie, waardoor infecties veel moeilijker te behandelen zijn.