Het proces van het produceren van eiwit uit een DNA-deoxyribonucleïnezuur-sequentie omvat twee belangrijke stappen: transcriptie en translatie. Tijdens transcriptie wordt een boodschapper ribonucleïnezuur, of mRNA, gemaakt van de DNA-matrijs. Dit mRNA combineert met een ribosomaal RNA, bekend als rRNA, en transfer-RNA, of tRNA, complex om de mRNA-code te vertalen in een aminozuursequentie, een eiwit. DNA is opgebouwd uit een opeenvolging van nucleotidebasen. De vier basen zijn adenine, thymine, guanine en cytosine. De volgorde waarin deze basen op een DNA-streng voorkomen, codeert uiteindelijk voor de aanmaak van bepaalde eiwitten. Nadat de cel de eiwitten heeft gemaakt, kunnen ze structureel of in verschillende metabolische processen worden gebruikt.
Maak een mRNA-transcript van de DNA-sequentie. Elke base in DNA komt overeen met een andere base. Foto's van DNA laten het meestal zien in een dubbele helix, waarbij de basen op één streng via bindingen verbonden zijn met de complementaire basen op de tegenovergestelde streng. Complementaire basen zijn: adenine (A) en thymine (T), en cytosine (C) en guanine (G). Dus als een DNA-streng A-C-G-C-T-A leest, dan is de complementaire streng T-G-C-G-A-T. Je kunt de sequentie van het mRNA-transcript op dezelfde manier vinden, door de complementen van de basen te gebruiken die in de DNA-sequentie worden getoond. RNA bevat echter niet de base thymine (T); in plaats daarvan wordt deze base vervangen door uracil (U). Als je een adenine (A) in de DNA-sequentie tegenkomt, match het dan met een uracil (U).
Als de DNA-sequentie A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A is, dan is de mRNA-sequentie U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Maak een tRNA-anti-codonsequentie van het mRNA-transcript. Elk tRNA heeft een set van drie basen die bekend staan als een anti-codon. Het anti-codon komt overeen met complementaire basen in de mRNA-sequentie. Om de algehele anti-codonsequentie te bepalen die overeenkomt met een mRNA-streng, hoeft u alleen de RNA-sequentie opnieuw te transcriberen; met andere woorden, schrijf de complementaire basen op. Met gebruikmaking van de eerder vermelde mRNA-sequentie is de tRNA-anti-codonsequentie A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A.
Breek de gevonden tRNA-sequentie in sets van drie basen. Omdat anticodons uit drie basen tegelijk bestaan, is AAT-CGC-UUA-CGA een betere manier om de anti-codonsequentie A-A-T-C-G-C -U-U-A-C-G-A te schrijven.
Tips
-
Je kunt de anti-codonsequentie nog sneller vinden door simpelweg de DNA-sequentie te schrijven, met U voor uracil in plaats van T voor thymine. Splits vervolgens de sequentie in de drie basen anti-codons.
U kunt de anti-codonsequentie gebruiken om te matchen met de eiwitten die tijdens de translatie door elk tRNA worden toegevoegd, waardoor een aminozuursequentie ontstaat. Controleer echter of de aminozuurreferentiekaart die u gebruikt voor anticodons is (zie bronnen). Veel diagrammen voor aminozuursequencing geven eenvoudigweg de overeenkomende mRNA-codons weer in plaats van tRNA-anticodons, zodat u de stap van het bepalen van de anti-codonsequentie kunt overslaan.
De sequentie van het tRNA-molecuul is gewoon een RNA-transcriptie van de DNA-sequentie die is gebruikt om het te maken.