Een centrifuge is een apparaat dat bestaat uit een compartiment dat rond een centrale as draait. De draaiende beweging zorgt ervoor dat materialen scheiden op basis van hun verschillende zwaartekrachten. Een centrifugerotor is de roterende eenheid van de centrifuge, die vaste gaten heeft die onder een hoek zijn geboord. Reageerbuisjes worden in deze gaten geplaatst en de rotor draait om te helpen bij het scheiden van de materialen. Er zijn drie soorten centrifugerotoren: zwenkbare rotoren, rotoren met vaste hoek en verticale rotoren.
Een draai-emmerrotor ondersteunt meestal monsters met een volume van 36 ml tot 2,2 ml. Swing-buckets kunnen twee soorten scheidingen ondersteunen: tarief-zonaal en isopycnisch. Swing-buckets hebben de voorkeur voor tarief-zonale scheidingen, omdat de afstand tussen de buitenkant van de meniscus en de buitenkant van de bodem van de buis lang genoeg is om scheiding te laten plaatsvinden.
Rotors met een vaste hoek worden meestal gebruikt voor pellettoepassingen om deeltjes uit een suspensie te pelleteren en het overtollige vuil te verwijderen, of om de pellet te verzamelen. Rotorholten variëren van 0,2 ml tot 1 ml. Het belangrijkste aspect bij de beslissing om een rotor met vaste hoek te gebruiken is de K-factor. De K-factor geeft aan hoe efficiënt de rotor kan pelleteren op maximale snelheid. Hoe lager de K-factor, hoe hoger de efficiëntie van de pelletisering.
Verticale rotoren zijn zeer gespecialiseerd. Ze worden meestal gebruikt om DNA in cesiumchloride te binden. Verticale rotoren hebben zeer lage K-factoren, wat handig is als het deeltje maar een korte afstand hoeft te verplaatsen totdat het pellets wordt. De looptijd op verticale rotoren is kort.