Divvirzienu DNS struktūra ir universāla visās dzīvajās šūnās, taču atšķirības pastāv metodēs, kā iegūt genomu DNS no dzīvnieku un augu šūnām. Lai gan genomu DNS dzīvo šūnu kodolā, ekstrahētās DNS daudzums un tīrība ir atkarīga no šūnas veida un lieluma. Piemēram, noteiktās šūnās ir vairāk DNS un piemaisījumu nekā citās. Lasiet tālāk, lai uzzinātu vairāk par DNS ekstrakcijas atšķirībām.
Vispārēja DNS ekstrakcija
Ja jūs ārstējat augu un dzīvnieku šūnas ar ziepjveida vielu, tas noārdīs lipīdus šūnā un kodola membrānās. Tad DNS maisījums atdalīsies no šūnu membrānām un olbaltumvielām. Pēc tam jūs varat izmantot spirtu, lai nogulsnētu DNS šķīdumā. Atkarībā no parauga daudzuma DNS var būt redzama ar neapbruņotu aci. Tomēr paturiet prātā, ka šī vienkāršā procedūra ne vienmēr rada augstas tīrības DNS.
Augu un dzīvnieku šūnas
Augu šūnas atšķiras no dzīvnieku šūnām, jo tām ir stingra šūnu siena un organoīdi, piemēram, hloroplasts. Tie satur arī olbaltumvielas un fermentus, kuriem ir nozīme fotosintēzē. Dažām augu šūnām ir poliploīdija, tas nozīmē, ka katrā šūnā tām ir vairāk nekā viena katras hromosomas kopija. Turklāt šūnu procesi, kas notiek augos, piemēram, fotosintēze, rada virkni sekundāro metabolītu. Dzīvnieku šūnās nav šūnu sienas, taču tām joprojām ir nepieciešamas ķīmiskas vielas, piemēram, nātrija dodecilsulfāts (SDS), lai izjauktu šūnu membrānu, lai atbrīvotu genomu DNS.
Augu DNS ieguve
Augu genoma DNS ir grūtāk iegūt augu šūnu sienas dēļ. To var noņemt, homogenizējot vai pievienojot celulāzi, lai noārdītu celulozi, kas veido šūnu sienu. Turklāt augu šūnā esošie metabolīti var traucēt DNS genomisko ekstrakciju, piesārņojot DNS paraugu nokrišņu procesā.
Dzīvnieku DNS ieguve
Perifēro asiņu leikocīti ir galvenais dzīvnieku genoma DNS avots, taču paraugu ņemšana ir sarežģīta, jo asinīm jānāk tieši no dzīvnieka. Asinis satur virkni savienojumu, piemēram, olbaltumvielas, lipīdus, balto asins šūnu, sarkano asins šūnu, trombocītu un plazmas, kas var piesārņot DNS paraugu. Tomēr no asins paraugiem iegūtās dzīvnieku DNS primārais piesārņotājs ir hēma, kas ir hemoglobīna sastāvdaļa, kas nav olbaltumviela.
DNS atšķirības
Augu un dzīvnieku DNS atšķirības slēpjas spirāles pamatu secībā. Augu šūnās sastopamo savienojumu dzīvnieku šūnās nav, un DNS bāzes secības to atspoguļo. Arī genoma auga DNS bieži ir lielāka nekā dzīvnieku DNS. Šīs atšķirības ietekmē arī ekstrakcijas metodes, ražu un DNS tīrību.