Baktērijas ir mazi, vienšūnu organismi, kas ir gan noderīgi, gan kaitīgi cilvēkiem. Dažas baktēriju formas palīdz mums dzīvot, piemēram, tās, kas palīdz noārdīt pārtiku mūsu zarnās. Citas formas, piemēram, baktērijas, kas izraisa Bubonic mēri, var nogalināt cilvēku, ja to neārstē. Ir daudz dažādu baktēriju veidu, un tās elpo, izmantojot dažādas metodes. Divas primārās baktēriju elpošanas metodes ir aerobā elpošana un anaerobā elpošana.
Aerobiski elpojošām baktēriju formām dzīvošanai nepieciešams skābeklis. Viņi izmanto skābekli kā degvielu, lai palīdzētu sadedzināt enerģiju un nodrošināt viņiem dzīvībai nepieciešamo enerģiju. Šis baktēriju elpošanas veids ir tāds pats kā cilvēki, tāpēc tiek lietots termins "aerobie vingrinājumi". Galvenais baktēriju aerobās elpošanas blakusprodukts ir oglekļa dioksīds.
Daudzi baktēriju veidi elpo anaerobā veidā. Citiem vārdiem sakot, viņi var iziet elpošanas procesu bez skābekļa klātbūtnes. Tā vietā, lai izmantotu skābekli, lai palīdzētu sadedzināt enerģiju pārtikā, šāda veida baktērijas izmanto citas dabiski sastopamas ķīmiskas vielas, lai radītu ķīmiskas reakcijas un atbrīvotu nepieciešamo enerģiju. Izmantotās dabiskās ķīmiskās vielas ir nitrāti, sulfāti un oglekļa dioksīds. Anaerobā elpošana baktērijās parasti rada daudz blakusproduktu. Daudzi no šiem blakusproduktiem var būt toksiski vai bīstami cilvēkiem, tostarp etanols un ūdeņradis.