Katra uz planētas dzīvojošā organisma klasificēšana ir svarīgs, tomēr neticami grūts biologu uzdevums. Sakarā ar plašo dzīvo organismu veidu klāstu, zinātnieks ir izveidojis vairākus veidus, kā identificēt katru no tiem. Izmantojot šos procesus, var izveidot sakārtotāku sistēmu, labākus nosaukumus un precīzākus ciltskokus.
Vispārējā identifikācija
Dzīvie organismi uz planētas ir iedalīti sešās valstībās: dzīvnieki, augi, arheebaktērijas, eubaktērijas, sēnītes un protisti. Katrai valstībai ir atšķirīgas fiziskās un bioloģiskās iezīmes. Sākot identificēt organismu, zināšana, kurai valstībai tas pieder, kalpo kā pirmais solis, lai vēl vairāk noteiktu konkrēto sugu.
Dzīvniekus un augus var viegli noteikt pēc fizikālajām īpašībām, taču arheebaktērijas un eubaktērijas nav viegli identificējamas, ja vien tās nepārbauda mikroskopā. Dažas sēnes izskatās kā augi, bet sēnītes nevar ražot pats savu pārtiku. Savukārt protisti ir jebkura dzīvā būtne, kas nepieder pie pārējām piecām karaļvalstīm.
Dihotomālā atslēga
Dihotomālā atslēga ir izplatīts rīks, ko biologi un citi dabaszinātnieki izmanto, lai kategorizētu nezināmu organismu. Šī “atslēga” ir virkne jautājumu vai paziņojumu, kuros tiek uzdots jautājums par organisma īpašajām īpašībām. Kad ir atbildēts uz jautājumu, tas noved pie cita jautājuma. Izmantojot šo jautājumu sēriju, var noteikt nezināmo organismu. Dihotomālās atslēgas parasti identificē lielos organismus, piemēram, augus un dzīvniekus, jo to īpašības ir viegli redzamas ar neapbruņotu aci. Mazāku organismu identificēšanai nepieciešama zinātniskāka pieeja.
Grama krāsošana
Grama krāsošana ir visizplatītākais process, ko izmanto baktēriju organisma identificēšanai. Baktēriju izmērs ir ārkārtīgi mazs, tas nozīmē, ka vienīgais veids, kā tās identificēt, ir mikroskops. Grama krāsošana ir ideāli piemērota jauniem baktēriju paraugiem, jo tos iekrāso vieglāk nekā pilnībā attīstītus. Grama krāsošana darbojas, pakļaujot baktēriju šūnu sienu divu veidu traipiem: violets un sarkans. Baktēriju ar biezākām šūnu sienām sauc par gram-pozitīvām baktērijām, jo tā saglabā pirmo traipu un neuzsūc otro, savukārt gramnegatīvā baktērijai ir plānāka šūnu siena un tā absorbējas gan. Grampozitīvās baktērijas ir violetas, savukārt gramnegatīvās - sārtas.
Molekulārā bioloģija
Ar tehnoloģiju attīstību biologi spēj izpētīt pat vismazāko dzīvo organismu molekulārās struktūras, identificējot katru organismu empīriskākā un zinātniskā veidā. Molekulārie biologi pēta baktērijas DNS un salīdzina to ar citu DNS, lai redzētu, vai pastāv līdzības. Tā kā DNS ir dzīvā organisma “bioloģiskā rokasgrāmata” un tā ir unikāla katram organisma tipam, tās identificēšana var būt ļoti specifiska un vienkārša.