Pat zinātnieki nav simtprocentīgi pārliecināti, kā veidojas ametista ģeodi vai kā veidojas kādi ģeodi. Nav bijis daudz pētījumu, jo ģeodi ir tikai jautras zinātniskas anomālijas, kurām ir maz zinātnisku ieguvumu, ja tādi ir. Tie ir ieži, kas ārēji šķiet gludi, bet, tos atverot, vidū atklājas dobums, kas piepildīts ar skaistiem kristāliem. Vispārēja zinātniskā vienprātība ir tāda, ka ametista ģeodi tiek izveidoti divpakāpju procesā. Pirmkārt, veidojas dobums un pēc tam kristāli.
Ametista ģeods ir doba klints ar ametista kristāliem, kas izklāta ar iekšējām sienām, tāpēc vispirms ir jāveido dobums. Tas var notikt visur, kur lava atrodas vai bija tuvu zemes virsmai. Tā rezultātā ametista ģeodus var atrast tūkstošiem vietu visā pasaulē. Pirmais solis dabiskajā procesā, kas rada ametista ģeodus, ir gāzes dobumu veidošanās lavā. Gāzes dobumi var veidoties no burbuļiem (tāpat kā karbonizācija izraisa burbuļus jūsu soda). Daži zinātnieki apgalvo, ka dobumus var veidot arī tad, kad dzesējošā lava plūst pie koku saknēm vai citām lietām, kas izlec no zemes. Atdzesējošā lava pirms sacietēšanas ap atsegumu pilnībā sacietē, izveidojot dobumu.
Pēc tam dobumus piepilda ar silīcija dioksīdu saturošu šķidrumu, kas satur nelielu daudzumu dzelzs. Laika gaitā šis šķidrums veido kristālus - sešpusīgas ametista piramīdas (romboedrus). Kristāli ar krāsu, kas svārstās no gaiši ceriņkrāsas līdz dziļi violetai, veidojas, ja šķidrumā ir dzelzs pēdas, kā rezultātā rodas ametista ģeodi.