Ekosistēmas, saīsināti no ekoloģiskajām sistēmām, rodas biotisko, abiotisko un kultūras komponentu mijiedarbībā. Biotiskās un kultūras sastāvdaļas ir visas dzīvās būtnes, kas nav cilvēciskas un cilvēku, ieskaitot mikroskopisko dzīvi, kas atrodas ekosistēmā. Abiotiskās sastāvdaļas ir tās nedzīvās lietas, īpaši ekosistēmas vides elementi, piemēram, ūdens, netīrumi un gaiss. Tuksneša ekosistēmā liela daļa no tā, kas sistēmu apzīmē par tuksnesi, ir nedzīva.
Akmens
Tuksneša karstums bieži apgrūtina dzīvu radību - gan augu, gan dzīvnieku - izdzīvošanu, atstājot plašas zemes platības. Tāpat kā lielākajā daļā citu ekosistēmu, klintis un citi tādi cietas zemes gabali ir sastopami visā tuksnesī. Starp tuksneša ekosistēmu akmeņiem var atrast noteiktus pusdārgakmeņu veidus, piemēram, kvarcu.
Smiltis
Smiltis, kas sastāv no smalkām iežu daļiņām, visticamāk ir visvairāk identificējamais tuksneša ekosistēmas elements. Vējam pūšot pa līdzenu zemi ar nelielu veģetāciju, lai nodrošinātu vairogu, klinšu gabali saplīst, veidojot smiltis.
Kalni
Lai arī parasti kalni nav saistīti ar plakanu, atklātu tuksnešu attēlu, ekosistēmā bieži sastopami kalni. Milzu gadu garumā stipra vēja cirsts tuksneša kalni bieži ir stāvi un nelīdzeni, nevis gludi un ripo.
Ūdens
Lai gan tuksneša ekosistēmā to nav tik daudz kā citur, ūdens tomēr atrodams visā tuksnesī. Daži tuksnesī sastopamie dzīves veidi ir atkarīgi no ūdens klātbūtnes, sākot no upju skriešanas līdz lietum un notecei.
Gaiss
Lai arī gaiss ir sastopams visās pārējās ekosistēmās, tuksneša veidošanā gaisam ir īpaši svarīga loma. Veģetācijas trūkums ļauj vējam pūst pāri zemei un lēnām izcirst akmeņus, kā rezultātā rodas gan smiltis, gan kalni. Tas ir arī vējš, kas rada tādas brilles kā smilšu kāpas un dabiskos tiltus.
