Kā aprēķināt Kcat

Uzzīmējiet produktu koncentrācijas un laika diagrammu datiem no fermentatīvā testa pirmās mēģenes. Piezīme: horizontālajai asij jābūt "laiks", un vertikālajai asij jābūt "produkta koncentrācijai".

Aprēķiniet lineāro regresijas līniju datu punktiem, kurus esat uzzīmējis 1. sadaļas 1. solī. Lai gan Excel un grafiku kalkulatori var viegli noteikt šo lineāro modeli, jūs varat iegūt regresijas novērtējumu līnijas slīpums, dalot produkta koncentrācijas starpību starp blakus esošajiem datu punktiem ar to laika starpību.

Ierakstiet lineārās regresijas līnijas slīpumu no 1. sadaļas 2. darbības kā "sākotnējais reakcijas ātrums (Vo)". Piezīme: regresijas līnijas modelī "[produkta koncentrācija] = m [laiks] + b" koeficients "m" ir slīpums.

Atkārtojiet 1., 2. un 3. darbību pārējām testa mēģenēm.

Uzzīmē substrātu koncentrācijas apgriezto vērtību katrai mēģenei pretēji sākotnējam reakcijas ātrumam (no 1. iedaļas 4. darbības). Piemēram, ja sākotnējais ātrums mēģenei ar sākotnējo substrāta koncentrāciju 50 mikromolāri (uM) bija 80 uM / s, inversi būtu 1/50 uM substrāta koncentrācijai un 1/80 uM / s sākotnējai ātrums. Piezīme: apgrieztajai substrāta koncentrācijai jābūt uz horizontālās ass, un apgrieztajam sākotnējam ātrumam jābūt uz vertikālās ass.

Piezīme: substrāta koncentrācijai jābūt uz horizontālās ass, un sākotnējam reakcijas ātrumam jābūt uz vertikālās ass.

Nosakiet diagrammas lineāro regresijas līniju, kuru esat uzzīmējis 2. sadaļas 1. solī. Piezīme: tā kā jums būs jāzina regresijas līnijas y krustojums, punkti jāievada no 2. sadaļas 1. darbība Excel vai grafiku kalkulatorā un izmantojiet iebūvēto regresijas modelēšanu funkcionalitāte.

Sadaliet 1 ar y-krustpunktu no lineārās regresijas līnijas. Tas dos jums apgrieztās vērtības Vmax vērtību, fermenta maksimālo reakcijas ātrumu. Piezīme: ja lineārās regresijas modelis ir "[Inverse Vo] = m [Inverse Substrate Conc.] + B", tad "b" vērtība būs y krustpunkts. Sadaliet 1 ar "b", lai aprēķinātu Vmax apgriezto vērtību.

Lai aprēķinātu faktisko Vmax vērtību, daliet 1 ar rezultātu no 2. sadaļas 3. darbības.

Nosakiet fermenta koncentrāciju sākotnējā testā (skatīt sākotnējos datus). Piezīme: fermentu koncentrācija visām mēģenēm ir vienāda; testā mainās tikai substrāta koncentrācija.

Daliet Vmax (no 2. sadaļas 4. posma) ar fermenta koncentrāciju (no 2. sadaļas 5. posma). Rezultāts ir Kcat vērtība.

Čikāgā dzīvojošam reklāmas tekstu autoram Endijam Pasquesi ir liela pieredze automobiļu (BMW, MINI Cooper, Harley-Davidson), finanšu pakalpojumu (Ivy Funds, William Blair, T.) rakstīšanā. Rowe Price, CME Group), veselības aprūpes (Abbott) un plaša patēriņa preču (Sony, Motorola, Knoll) klienti. Viņš ir ieguvis mākslas bakalauru angļu valodā Hārvardas universitātē, bet par Oksfordas komatu nerūpējas.

  • Dalīties
instagram viewer