Ūdenim pārvietojoties pa augsni, tas aiznes dažas augu izmantotās uzturvielas, piemēram, nitrātus un sēru. Šo procesu sauc par izskalošanos. Normālos apstākļos ar tipiskiem nokrišņiem notiek neliels izskalošanās līmenis, un organisko materiālu sadalīšanās uz virsmas atjauno augsni. Pārmērīgu nokrišņu vai apūdeņošanas gadījumā augsnes izskalošanās sekas var būt dramatiskākas.
Augsnes paskābināšana
Tāpat kā peldbaseins, arī augsne uztur pH līmeni. Būtībā zemāks pH nozīmē lielāku skābumu. Lauksaimniecības augu ražošanā, piemēram, lauksaimniecībā, labākos rezultātus parasti rada nedaudz skāba augsne. Ja izskalošanās noņem augsnē pārāk daudz nitrātu, tomēr pH līmenis nokrīt pārāk tālu un augsne kļūst pārāk skāba. Augsnes paskābināšanās pati par sevi rada daudzas negatīvas sekas, tostarp izmaiņas augsnes mikrobu tipos, virszemes ūdeņu piesārņojums un slieku populācijas samazināšanās.
Pazemes ūdeņu piesārņojums
Tā kā ūdens barības vielas ved prom no augsnes virskārtas, dažas barības vielas paliek zemākajos augsnes līmeņos. Pārējās barības vielas nonāk gruntsūdeņos, kā rezultātā virszemes augi pastāvīgi zaudē šīs barības vielas. Šis nitrātu pārpalikums gruntsūdeņos rada zināmus draudus cilvēku veselībai. Zīdaiņiem trūkst spējas pienācīgi apstrādāt nitrātus un pārvērst tos nitrītos, kas saistās ar hemoglobīnu un ierobežo skābekļa sadalījumu organismā. Bažas rada arī tas, ka virkne pesticīdu dēles procesā nonāk gruntsūdeņos. Pesticīdu iedarbībai ir nopietnas sekas veselībai, sākot no iedzimtiem defektiem līdz vēzim.
Sāls noņemšana
Augsnes sāls noņemšana ir viens noderīgs izskalošanās pielietojums. Augsts sāls saturs augsnē ierobežo sēklu dīgtspēju, kā arī augu augšanu un ražas ražu. Kontrolēta izskalošanās, parasti izmantojot apūdeņošanu, noņem vai samazina kopējo sāls saturu augsnē, ļaujot iegūt veselīgākas kultūras. Dažos gadījumos procesam nepieciešama arī mākslīgas drenāžas metode.
Erozija
Kaut arī barības vielu izskalošanās nav tieši atbildīga par eroziju, tā nodrošina erozijas iespējamību. Piemēram, augsnes paskābināšana var ierobežot augu tipus, kas aug noteiktā apgabalā, kas noved pie slikti attīstītas sakņu sistēmas. Šī sliktā sakņu sistēmas attīstība kopā ar slieku populācijas samazināšanos, kas veicina augsnes kvalitāti, palielina noteces un vēja likvidēšanas augsnes virskārtu.