Patogēnās baktērijas augsnē

Patogēni ir mikrobi, kas savos saimniekos izraisa slimības. Lai gan augiem parasti ir vairāk jābaidās no augsnē izplatītām patogēnām sēnēm nekā no augsnes pārnēsātām baktēriju slimībām, dažādas augsnē dzīvojošās patogēnās baktērijas izraisa slimības arī augos. Ir pārāk daudz augsnes augu patogēnu sugu, lai tos visus uzskaitītu, taču šādi ir daži no vissvarīgākajiem vai izplatītākajiem. Dažas baktēriju sugas augsnē var izrādīties bīstamas vai pat nāvējošas arī cilvēkiem.

C. botulīns ir grampozitīva baktērija (t.i. baktērija, kuras rezultāts ir pozitīvs pēc Grama krāsošanas testa), kas veido izturīgas, izturīgas sporas. Kad sporas atrod pareizos apstākļus, tās dīgst un sāk augt. Viņi var radīt letālu olbaltumvielu, ko sauc par botulīna toksīnu, kas iedarbojas uz cilvēku un citu zīdītāju nervu sistēmu, lai bloķētu galvenā neirotransmitera, ko sauc par acetilholīnu, izdalīšanos. C. botulīna sporas augsnē un ūdenī ir atrodamas daudzos pasaules reģionos. Tie ir anaerobi un aug tikai bez skābekļa; skābie apstākļi kavē to augšanu. Lai arī C. botulīns dažkārt izraisa letālus gadījumus, kad pārtiku pārnēsā slimība, ko sauc par botulismu - spēcīgo toksīnu, ko rada baktērija ir kļuvusi noderīga arī cilvēku muskuļu audu paralizēšanai dažādu medicīnas vai kosmētikas līdzekļu ietvaros procedūras. Lietojot kā terapeitisku līdzekli, botulīna toksīns ir pazīstams ar tā tirdzniecības nosaukumu Botox.

E. karotovora ir ļoti postošs patogēns, kas izraisa slimības plašā augu klāstā, ieskaitot kartupeļus un lielāko daļu citu gaļīgu dārzeņu. Šī gramnegatīvā, stieņa formas baktērija var iebrukt kultūrās laukā vai glabājot. E pasuga. carotovora carotovora labi izdzīvo augsnē un virszemes ūdeņos; tas var augt daudzu citu kultūru vai pat nezāļu sugu sakņu zonās, iebrūkot kartupeļos vai citās neaizsargātās kultūrās, ja tāda ir iespēja. Parastās kartupeļu slimības, ko izraisa E. karotovora ietver melno kāju, gaisa kātu puvi un bumbuļu mīksto puvi.

Streptomyces kašķis ir grampozitīvas baktērijas, kas kopā ar divām citām Streptomyces sugām (S. acidiscabies un S. kaņepju kaņepes) var inficēt kartupeļus un citas sakņu kultūras, piemēram, bietes, redīsus, rāceņus, burkānus un pastinakus. Tas ir neparasti ar to, ka, augot, šūnas veido pavedienus, kas līdzīgi sēņu veidotajiem - kaut arī daudz mazāki. S. pavedieni pēc tam kašķis var atdalīties, veidojot sporas. Baktērijas izplatās, iebrūkot jaunos, svaigus audos un iekļūstot vecākos audos, izmantojot brūces vai dabiskas atveres.

Xanthomonas ir ģints, kas ietver daudzus nozīmīgus augu patogēnus. Lai gan augsnē tie neiztur ļoti ilgi, dažas sugas ziemā var izdzīvot augsnē un pavasarī inficēt jaunu kultūru. Tāpat kā visas pārējās proteobaktērijas, tās ir gramnegatīvas. X suga. campestris izraisa melno puvi visdažādākajos augos un, iespējams, ir vissvarīgākais ģints pārstāvis. Ironiski, bet to pašu baktēriju audzē komerciāli, lai ražotu ksantāna sveķus, kas ir kopēja pārtikas piedeva.