Mikroskopai buvo naudojami daugelyje skirtingų sričių, norint stebėti smulkius mėginius. Yra įvairių tipų mikroskopai, kurių kiekvienas turi savo metodus skirtingiems tam tikro mėginio aspektams peržiūrėti. Daugumoje mikroskopų yra objektyvų rinkinys ir okuliaro lęšis, leidžiantis matyti padidintą vaizdą. Prie daugelio mikroskopų taip pat galima pridėti kamerą, kad būtų galima fotografuoti vėliau. Mokomieji mikroskopai paprastai turi du okuliarų rinkinius, todėl kitas asmuo gali matyti tą patį vaizdą kaip ir asmuo, valdantis aparatą.
Junginys
Labiausiai nebrangus ir įprastas laboratorijose naudojamas mikroskopas yra sudėtinis mikroskopas. Šiuose mikroskopuose objektams padidinti naudojami įvairaus stiprumo lęšiai. Sudėtiniuose mikroskopuose paprastai yra okuliaras, veidrodžių rinkinys ir objektyvas, kurie veikia kartu. Vaizdai matomi dviem matmenimis. Naudodamasis mikroskopo kameros tvirtinimu, stebėtojas gali išsaugoti vaizdus analizei atlikti vėliau.
Skenuojantis elektroninis mikroskopas
Skenuojantis elektroninis mikroskopas gali stebėti objektus su 3D vaizdu. Vaizdai yra labai didinami ir skiriami, tačiau jie rodomi nespalvoti. Norėdami padaryti išsamius vaizdus, bandinys padengtas aukso dalelėmis. Elektronai atšoka nuo aukso dangos, kad gautų vaizdą. Šio tipo mikroskopas yra naudingas labai smulkiems objektams peržiūrėti, o vaizdai išsaugomi, kad būtų galima juos peržiūrėti vėliau. Dažnai žiūrimi objektai yra išsamūs bakterijų, virusų ir kai kurių ląstelių komponentų vaizdai.
Transmisijos elektronų mikroskopas
Šio tipo mikroskopas naudoja elektronus, kad praleistų mėginį. Dviejų matmenų vaizdai gaminami kuriant plonas, didelės skiriamosios gebos ir didelio padidinimo riekeles. Perdavimo elektroniniai mikroskopai yra naudingi norint gauti vaizdus ne tik dėl paviršiaus, bet ir per bandinio storį. Kadangi šie mikroskopai yra brangūs, juos greičiausiai galima rasti pagrindinėse tyrimų įstaigose ir universitetuose.
Stereoskopas
Stereoskopai gali būti naudojami objektams peržiūrėti iš trijų matmenų. Padidinimas nėra toks stiprus, kaip kitų tipų mikroskopuose, tačiau leidžia pamatyti detales, kurių kitaip plika akimi nematyti. Jie taip pat vadinami „skrodimo“ mikroskopais, nes jie dažniausiai naudojami mažų egzempliorių skrodimui.
Fluorescencijos mikroskopas
Mikroskopai gali būti naudojami norint pamatyti įvairius pavyzdžio aspektus, keičiant, kaip kuriamas vaizdas. Fluorescenciniuose mikroskopuose sąveikai su dažais naudojamos specifinės šviesos spalvos. Kai dažikliai apšviečiami, tam tikras struktūras galima izoliuoti ir žiūrėti su atitinkamais dažikliais. Šio tipo mikroskopas yra naudingas norint stebėti specifinius baltymus ląstelėje. Vaizdams iš mikroskopo užfiksuoti paprastai pritvirtinama kamera.