Taksonomijos centre yra organizmų klasifikavimas ir įvardijimas. Mokslininkai organizmus skirsto pagal panašias savybes. Siekdami išvengti painiavos dėl panašumo, biologai nustatė klasifikavimo taisyklių rinkinį. Taksonomijoje organizmai skirstomi į daugybę vis specifiškesnių grupių ir pavadinami pagal griežtas pavadinimo sutartis.
Kokie panašumai?
Pirmas dalykas, kurį mokslininkai turi įvertinti klasifikuodami organizmus, yra tai, kokių panašumų jie turi. Tai, kad du organizmai turi savybę, dar nereiškia, kad jie turėtų būti priskirti tai pačiai grupei. Pavyzdžiui, skraido ir paukščiai, ir bitės, tačiau jie tai daro remdamiesi labai skirtingais mechanizmais. Šie panašių bruožų tipai vadinami analogiškomis savybėmis; jie naudojami tai pačiai funkcijai atlikti. Tačiau biologai organizmus klasifikuoja pagal homologinius požymius. Homologiniai bruožai yra panašūs savo vidiniais mechanizmais. Pavyzdžiui, erelio sparnas turi vidinių panašumų su flamingo sparnu.
Klasifikavimo lygiai
Biologai organizmus skirsto pagal vis specifiškesnių kategorijų hierarchiją. Šią hierarchiją XVIII amžiuje pasiūlė Carlas Linnaeusas. Linnaeus pasiūlė septynias vis didėjančio specifiškumo kategorijas: karalystė, šeimos, klasė, tvarka, šeima, gentis ir rūšys. Nors Linnėjus iš pradžių aprašė tik augalų ir gyvūnų karalystę, kiti modeliai apima penkias ar daugiau karalysčių. Kai kurie šiuolaikiniai taksonominiai modeliai taip pat turi platesnę kategoriją, vadinamą domenu virš karalystės. Konkrečiausia organizmo taksonominė kategorija yra jo rūšis. Apskritai tai reiškia organizmų grupę, kuri natūraliai veisiasi toje grupėje.
Konvencijų pavadinimas
Linnaeus taip pat nustatė griežtas visų organizmų vardų suteikimo taisykles. Moksliniai organizmų pavadinimai apima lotyniškas arba lotyniškas ne lotynų kalbos žodžių versijas. Šie pavadinimai rašomi paprastai kursyvu. Dvejetę mokslinio pavadinimo versiją sudaro dvi dalys: gentis ir rūšis. Pavyzdžiui, žmonės yra Homo sapiens. Homo yra gentis, o sapiens - rūšis. Organizmo rūšiniame pavadinime paprastai nurodoma pirmoji genties pavadinimo raidė, po kurios rašoma mažosios rūšies pavadinimas. Pavyzdžiui, žmogaus rūšies pavadinimas yra H. sapiens.
Programos
Taksonomija yra didesnėje biologijos šakoje, vadinamoje sistematika. Sistema yra susijusi su organizmų evoliucija ir giminyste bei klasifikacija. Taigi biologai naudoja taksonomijos duomenis ir klasifikacijas, norėdami sukurti evoliucinius medžius organizmams. Biologai gali sukurti šias diagramas, remdamiesi daugybe skirtingų kriterijų, ir šie diagramų metodai gali būti naudojami hipotezėms apie evoliucijos istoriją generuoti.