Filogenetinis medis yra grafinis evoliucinių santykių vaizdas, parodantis, kaip organizmai galėjo atsiskirti nuo bendro protėvio. Anksčiau tai buvo daroma palyginus gyvų organizmų ir fosilijų anatomiją ir fiziologiją, tačiau dabar dažniausiai naudojama genetinė informacija, paimta iš DNR nukleotidų sekų. Organizmų, turinčių nedaug panašumų, galima rasti ant atskirų filogenetinio medžio „šakų“, o organizmai, turintys specifinių bendrybių, būtų tos pačios šakos „šakelėse“. Filogenetinis medis yra būdas suprasti organizmų rūšis ir evoliucinius pokyčius.
Santykių palyginimui pasirinkite modelio organizmą. Tai galima padaryti su rūšimi, veisle ar nukleotidų seka, atstovaujančia organizmą. Organizmo pavyzdys gali būti karvė. Likusi medžio dalis pademonstruotų, kiek karvė yra susijusi su kitais organizmais, remiantis genetinėmis savybėmis.
Pasirinkite išorinę grupę. Išorinė grupė yra mažiau glaudžiai susijęs organizmas arba labai skirtinga nukleotidų seka. Jei pavyzdinis organizmas yra karvė, tada galimas išeitis būtų žuvis. Kuo daugiau skirtingų organizmų yra, tuo giliau filogenetiniame medyje bus jų išsišakojimo taškas. Laikas pateikiamas su seniausia data diagramos apačioje, o ši diena - diagramos viršuje. Šakų išdėstymas rodo maždaug tai, kada praeityje evoliucijos bruožas galėjo pakeisti protėvių organizmą į skirtingas rūšis.
Nustatykite charakteristikų rinkinį, kurį norite naudoti palyginimui. Tokie pavyzdžiai yra „turi keturias kojas“, „kramtomi glamonės“, „gimdo gyvai“ arba „auga plaukai“. Nukleotidų sekos yra teisingos abėcėlės tvarka pavaizduoti DNR, lemiantys charakteristikas, todėl kitas variantas būtų: "yra seka ATGGACACGGA “.
Skirstykite organizmus pagal savybes. Kai viename organizme nėra norimo požymio, filogenetiniame medyje padaryta šaka. Dėl charakteristikos „turi keturias kojas“ karvės, avys ir elniai būtų vienoje šakoje, o žuvys - atskiroje šakoje. Viršutiniame plakato lentos kampe įklijuokite karvės paveikslėlį ar seką, o priešingame kampe - žuvis ir nubrėžkite dvi linijas nuo jų iki popieriaus pagrindo susikertančios V formos.
Tęskite modelių organizmų arba nukleotidų sekų atskyrimą, kol kiekviename pavyzdyje bus atskirai atskirta nuo šakos į šakelę. Būdingas žodis „turi vilnos“ atskirtų avis nuo elnių ir karves ant vienintelės šakos. Padėkite avies atvaizdą šalia žuvies paveikslo ir nubrėžkite liniją, kuri V formos pavidalu jungiasi iki karvės šakos. Naudojant charakteristiką „turi purią uodegą“, karvė būtų atskirta nuo elnių. Įklijuokite elnio paveikslą tarp karvės ir avies ir nubrėžkite kitą liniją į V formą, kuri kertasi virš žuvų ir avių linijų. Kai kiekviena rūšis turi po vieną šaką, filogenetinis medis yra baigtas.