Tinkamai paženklinti modeliai akademiniams ar demonstraciniams tikslams tampa daug naudingesni. Etiketės turi būti tikslios, suprantamos ir įskaitomos.
Kuo modelis yra sudėtingesnis, tuo svarbesnis tampa tinkamas ženklinimas. A DNR modelis tinkamai paženklinta reprezentuoja vieną iš sudėtingiausių gyvenimo struktūrų ir atrodo elegantiškai paprasta.
DNR struktūra
Dezoksiribonukleino rūgštis (DNR) struktūra atrodo kaip susuktos kopėčios, pagamintos iš šešių skirtingų dalių. Kopėčių šonai susideda iš dviejų dalių, penkių anglių cukraus, vadinamo dezoksiriboze, ir fosfato molekulės.
Kopėčių pakopos susidaro iš porų azoto bazės. Adeninas ir timinas sudaro vieną porą, o citozinas ir guaninas - kitą.
Dėl savo cheminės struktūros šios bazės jungiasi tik šiose porose. Jei kiekviena bazė rodoma skirtinga spalva, pavyzdžiui, geltona - adeninas, o mėlyna - timinas, žiūrovui bus lengviau suprasti modelį.
(Žr. Šaltinius DNR modelio konstravimo praktikai.)
Vandenilio jungtys laikykite kartu azoto bazių poras, tačiau leiskite poroms atsiskirti, kai DNR molekulė replikuojasi. Atsižvelgiant į projekto instrukcijas, šios vandenilio jungtys gali būti rodomos arba nerodomos. Jei reikia, vandenilio ryšys DNR modeliuose gali būti parodytas naudojant dantų krapštukus ar mažus magnetus kaip jungtis arba pavaizduotas blizgučiais ar blizgučiais.
Projekto ženklinimas etiketėmis
Etiketės turi būti įskaitomos. Puošnūs ar įmantrūs šriftai daro etiketes sunkiau skaityti ir suprasti, todėl naudokite paprastus, lengvai skaitomus šriftus. Be to, naudokite tinkamo dydžio šriftą. Kuo didesnis žiūrovo atstumas nuo modelio, tuo didesnis turi būti šrifto dydis.
Etiketėse turėtų būti pakankamai informacijos, kad modelis būtų suprantamas pats. Vienodo ar labai panašaus formato naudojimas visoms etiketėms taip pat padeda suprasti.
DNR molekulių projekto ženklinimas
Sukonstravę DNR modelį ir jo dalis pažymėkite aiškiai ir tiksliai. Trumpi paaiškinimai ir apibrėžimai labai pagerins projektą.
DNR modelis turėtų turėti didesnę etiketę, nes tai yra visos struktūros pavadinimas. Papildoma informacija, kurios gali prireikti, yra modelio gamintojo vardas, pavardė, pagaminimo data arba terminas, instruktoriaus vardas ir klasės pavadinimas.
Aiškinimas DNR molekulė taip pat gali prireikti projekto. Pastraipos paaiškinimui greičiausiai reikės bent jau aprašyti dvigubos spiralės struktūrą ir trumpai aptarti DNR molekulės reikšmingumą.
Instrukcijose taip pat gali reikėti statinio atradėjų pavardžių (Crickas ir Watsonas su Rosalindo Franklino ir Maurice'o Wilkinso darytomis rentgeno difrakcijos nuotraukomis). Vykdykite projekto nurodymus.
Pažymėkite fosfato molekulę: Fosfato molekulės susideda iš fosfato atomo, apsupto keturiais deguonies atomais. Fosfato molekulės sudaro jungtis palei DNR molekulės bėgius ar šonus. Tvist DNR struktūra iš dalies gaunamas iš šių molekulių.
Pažymėkite dezoksiribozės molekulę: Antroji DNR susuktų kopėčių bėgių arba šonų dalis yra dezoksiribozės molekulė. Dezoksiribozė yra penkių cukrų molekulė, vadinama riboze, netekusi deguonies atomo (dezoksi-). Ši molekulė jungiasi su azoto bazės kryžminiais ryšiais arba pakopos, DNR kopėčių.
Pažymėkite pagrindo poras: Kiekvieną DNR kopėčių pakopą sudaro viena bazių pora - adeninas ir timinas arba guaninas ir citozinas. Šių keturių azoto bazių cheminė struktūra užkerta kelią kitiems deriniams. Jei nurodant nurodymus bazės turi parodyti santykinį dydį, adeninas ir guaninas yra šiek tiek didesnės molekulės.
Adeninas ir timinas: Standartinė praktika leidžia pažymėti adeniną kaip A, o timiną - kaip T, tačiau ant modelio turi būti bent viena pakopa, pažymėta visais pavadinimais ir raidžių pavadinimais.
Pavyzdžiui, viena azoto adenino bazė turėtų būti paženklinta Adeninu (A), o prijungta azoto bazė - timinu (T). Jei šios etiketės yra aiškiai pateiktos, likusios adenino bazės gali būti pažymėtos A etikete, o timinas partneris gali būti pažymėtas T. Dar kartą patikrinkite nurodymus.
Guaninas ir citozinas: Standartinė praktika leidžia žymėti guaniną kaip G, o citoziną - kaip C, tačiau modelis turi turėti bent vieną pakopą, pažymėtą visais pavadinimais ir raidžių pavadinimais.
Pavyzdžiui, viena azotinė guanino bazė turėtų būti paženklinta Guaninu (G), o prijungta azotinė citozino bazė turėtų būti pažymėta citozinu (C). Jei mokytojas sutinka, likusias guanino bazes galima pažymėti G, o citozino bazes - C.
Vandenilio jungtys DNR modelyje
Jei pagal modelio reikalavimus nurodomas vandenilio ryšys, atsargiai pažymėkite vandenilio ryšių vietas tarp adenino ir timino bazių, taip pat tarp guanino ir citozino bazių.
Jei etiketės negalima tiksliai uždėti ant vandenilio jungties vietos (vietų), uždėkite ją kuo arčiau. Rodyklės, jei naudojamos, turėtų kirsti kuo mažiau modelio.
Nustatykite nukleotidą: A nukleotidas susideda iš grupės, kurioje yra viena fosfato molekulė, viena dezoksiribozės molekulė ir viena azoto bazė. Etiketė, identifikuojanti vieną nukleotidą, turėtų aiškiai parodyti tris sujungtas molekules kaip grupę.
Norint sujungti tris nukleotido dalis su etikete, galima naudoti rodykles, stygas ar identifikacinius žymenis, pavyzdžiui, atitinkančius žvaigždžių lipdukus.