Mikroskopas yra viena svarbiausių mikrobiologo priemonių. Jis buvo išrastas 1600-aisiais, kai Antonas van Leeuwenhoekas pastatė paprastą mėgintuvėlio, didinamojo lęšio ir scenos modelį, norėdamas padaryti pirmuosius vizualius bakterijų ir cirkuliuojančių kraujo ląstelių atradimus. Šiais laikais mikroskopija yra būtina medicinos srityje, kad būtų galima rasti naujų ląstelių atradimų, o mikroskopų tipai gali būti klasifikuojami pagal fizinius principus, kuriuos jie naudoja vaizdui generuoti.
Šviesos mikroskopai
Kai kurie dažniausiai laboratorijose aptinkami taikymo sritis naudoja matomą projektuojamą šviesą, kad apšviestų ir padidintų objektą. Esminis šviesos diapazonas - skrodimas arba stereomikroskopas - leidžia iš karto pamatyti visą organizmą, tuo pačiu rodant detales, pavyzdžiui, drugelio antenas didinant 100x150x. Sudėtiniuose taikymo srityse, naudojamuose smulkesnėse ląstelių detalėse, yra dviejų tipų lęšiai, kurie padidina vienaląsčius organizmus 1000–1 500 kartų. Labiau specializuoti yra tamsaus lauko ir fazių kontrastiniai mikroskopai, kurie išsklaido šviesą, kad užfiksuotų ne tik gyvas ląsteles, bet net ir vidines ląstelių dalis, tokias kaip mitochondrijos.
Fluorescenciniai mikroskopai
Fluorescuojančiame arba konfokaliniame mikroskope kaip šviesos šaltinis naudojama ultravioletinė šviesa. Kai ultravioletinė šviesa patenka į daiktą, ji sužadina objekto elektronus, skleisdama įvairių spalvų šviesą, kuri gali padėti identifikuoti organizmo viduje esančias bakterijas. Skirtingai nuo sudėtinių ir skrodimo apimčių, fluorescenciniai mikroskopai rodo objektą per konfokalinę skylę, todėl visas mėginio vaizdas nerodomas. Tai padidina skiriamąją gebą, uždarant išorinę fluorescencinę šviesą ir sukuriant švarų trimatį mėginio vaizdą.
Elektroniniai mikroskopai
Elektronų mikroskope naudojamas energijos šaltinis yra elektronų pluoštas. Pluošto bangos ilgis yra išskirtinai mažas, o šviesos mikroskopijos metu žymiai padidėja vaizdo skiriamoji geba. Visi objektai yra padengti auksu arba paladžiu, kuris nukreipia elektronų pluoštą, sukurdamas tamsius ir šviesius plotus kaip 3D vaizdus, žiūrimus monitoriuje. Galima užfiksuoti tokias detales kaip sudėtingi jūros diatomų silicio dioksido apvalkalai ir virusų paviršiaus detalės. Tiek perdavimo elektronų mikroskopai (TEM), tiek naujesni nuskaitymo elektronų mikroskopai (SEM) patenka į šią specializuotą mikroskopijos kategoriją.
Rentgeno mikroskopai
Kaip rodo pavadinimas, šiuose mikroskopuose vaizdui sukurti naudojami rentgeno spinduliai. Skirtingai nei matoma šviesa, rentgeno spinduliai neatspindi ar lengvai lūžta, jie nematomi žmogaus akiai. Rentgeno mikroskopo vaizdo skiriamoji geba patenka tarp optinio ir elektrono mikroskopu ir yra pakankamai jautrus, kad būtų galima nustatyti atskirą atomų išsidėstymą a molekulėse krištolas. Skirtingai nuo elektroninės mikroskopijos, kai objektas yra džiovinamas ir fiksuojamas, šie labai specializuoti mikroskopai gali parodyti gyvas ląsteles.
