Kaip ir dauguma biomų Žemėje, savanų ekosistema išgyvena subtiliai išlaikiusi pusiausvyrą tarp aplinkos veiksnių ir įvairių rūšių, įskaitant žmones. Dėl stiprios sausros šiems žolynams gali būti atimta gyvybę suteikianti vandens ir lapija, o brakonieriams ir čiabuviai dažnai grasina sutrikdyti maisto tinklą nužudydami gyvūnus sportui ar išgyvenimas.
Žmogaus veikla
Žmogaus veikla gali labai sukelti grėsmę savanos ekosistemų sutrikdymui. Netvarus vandens naudojimas ir drėkinimo metodai gali išsausinti gyvybines upes ir vandens skylutes. Regionuose, kur čiabuviai į savo mitybą reguliariai įtraukia laukinę mėsą, kanopinių populiacija pastebimai sumažėjo. Kai kurie savanos laukiniai gyvūnai taip pat medžiojami kaip trofėjai; visų pirma juodosios raganosiai medžiojami dėl vertingų ragų. Net kai kurios augalų rūšys yra derlingos dėl jų komercinės vertės. Drožiniai iš afrikinio juodmedžio, savanos medžio, dažnai parduodami turistų turguose.
Sausra ir sunkus ganymas
Ilgai trunkanti sausra daro pavojingą poveikį savanų ekosistemai, o ganymo būdai šį poveikį dar labiau sustiprina. Didelės sausros ir ganymo derinys visų pirma valgomų, daugiamečių žolių žolyną gali pakeisti savana, kurioje vyrauja nevalgomos žolės ir augalai. Lengvai ganomos pievos išlaiko malonių, daugiamečių žolių rūšių kokybę, tačiau augalų rūšių sudėtį vis tiek galima pakeisti. Ekspertai reikalavo ganyklų valdymo sprendžiant sausros epizodus, kad būtų paveikta potencialių pokyčių kryptis siekiant pievų tvarumo.
Dykumėjimas
Atogrąžų savanos dažnai ribojasi su sausais, dykumos regionais, o dykumą primenančių sąlygų išplitimas į sausas pievų teritorijas vadinamas dykumėjimu. Ši grėsmė savanų ekosistemai apima klimato pokyčių, ūkininkavimo praktikos, per ganymo, agresyvus žemės ūkio drėkinimas, kuris sumažina vandens lygio lygį nuo augalų šaknų, miškų naikinimo ir erozija. Kasmet daugiau kaip 46 000 kvadratinių kilometrų Afrikos savanos tampa dykuma. Sodinant sausrai atsparius augalus, galima stabilizuoti besikeičiančias smėlio kopas ir pradėti augti papildomą augaliją.
Anglies dioksido išmetimas
2012 m. Apklausoje didelis sumedėjusių augalų masės padidėjimas buvo susijęs su „CO2 tręšimo efektu“. Autoriai teigė, kad sumedėjusių augalų augimo tempą padidino padidėjęs atmosferos anglies kiekis dioksidas. Dramatiškai išaugęs medžių ir krūmų kiekis gali kelti grėsmę visai savanų ekosistemai, nes šie augalai sunaudoja daugiau vandens nei žolės. Gamtosaugininkai Namibijoje pranešė, kad sumedėję augalai kliudė ir antilopę, ir juos medžiojantys gepardai - raida, galinti turėti nežinomų pasekmių visoje Europoje žolynai.
