Vietiniai Masačusetso žinduoliai yra tokie patys įvairūs, kaip šios gražios valstijos šiaurės rytų JAV topografija. 2009 m. Vasario mėn. Masačusetso žuvininkystės ir laukinės gamtos skyrius nurodo, kad valstijoje galėjo būti 60 vietinių žinduolių. Į šį skaičių neįeina dešimtys papildomų valkataujančių ar Masačusetse introdukuotų rūšių. Vietiniai žinduoliai valstybėje yra placentos ir gali būti klasifikuojami pagal jų dažniausiai mėgstamas sausumos ar jūrų buveines.
Woodland žinduoliai
Masačusetso miškus sudaro mišrūs miškai, kuriuose vyrauja spygliuočių ar lapuočių medžiai. Vietiniai žinduoliai, dažnai mėgstantys spygliuočių regionus, yra raudonosios ir skraidančios voverės, sniego batų kiškiai, briedžiai ir žvejai. Lapuočių vietose dažnai pastebimi oposumai, pilkosios voverės, burundukai, elnių pelės, raudonosios ir pilkosios lapės, baltasuodegiai elniai, porcupinai ir kelios šikšnosparnių rūšys. Kojotai palankiai vertina krūmines šveitimo vietas. Juodieji lokiai dažnai būna spygliuočių ir lapuočių buveinėse. Nors žmonės jų bijo, jie paprastai nepuola žmonių, bet mieliau pabėga į mišką.
Žoliniai žolynai
Masačusetso pievų plotai apima laukus, pievas ir dirbamą žemę. Gimtiniai žinduoliai, kurie teikia pirmenybę pievų buveinėms, yra kurmiai, šuo, triušiai, pelėnai ir gervės. Vietiniai žinduoliai, mėgstantys žolėtą plotą, dažnai atsiranda vejoje ir užmiesčio namų kiemuose ir paprastai laikomi kenkėjais. Kotedžų skaičius mažėja, nes valstybėje sumažėjo jų mėgstamų buveinių, tokių kaip dirbama žemė ir ganyklos.
Pelkių žinduoliai
Pelkės, pelkės, potvynio pakrantės, šlapios pievos ir pelkės apibūdina Masačusetso pelkių plotus. Visoje valstijoje yra šlapžemių plotai. Kai kurie vietiniai žinduoliai, tarp kurių mėgstamos buveinės yra pelkės, yra ondatros, kenkėjai, šikšnosparniai, šokinėjančios pelės, lemingai ir bobcats. Be kitų buveinių, lemmingai dažnai mėgsta spanguolių pelkes. Bobcats klaidžioja miškingomis ir šveitimo vietomis, taip pat pelkėta vietove šalia laukų. Jie yra vieninteliai laukiniai katinai, šiuo metu randami Masačusetse, labai drovūs ir nepagaunami.
Upė, tvenkinys ir žinduolių ežeras
Masačusetse yra daugybė įvairaus dydžio upių, tvenkinių ir ežerų. Vietiniai žinduoliai, kurie labiausiai mėgaujasi šiomis buveinėmis, yra ūdros, upių ūdros ir bebrai. Vizliai dažnai gyvena įvairiose buveinėse, tačiau nori būti netoli vandens. Upių ūdros daugiausia randamos prie vandens, tačiau kartais jos nuklys toli į miškingumą. Bebrai gėlo vandens vietovėse, tokiose kaip tvenkiniai, upės ir ežerai, stato užtvankas ir ložas su daugybe įėjimų.
Jūrų žinduoliai
Masačusetso Atlanto vandenyno pakrantėje yra daugybė uostų ir įlankų. Vietiniai žinduoliai šiuose vandenyse yra ruoniai, jūrų kiaulės ir kelios delfinų rūšys. Išoriniuose uostuose ir Atlanto vandenyno pakrančių vandenyse prie Masačusetso yra daug banginių rūšių, įskaitant žudikus, belugus ir bandomuosius banginius. Nykstantys banginiai, matomi šiuose vandenyse, yra kupra, pelekas, spermatozoidai ir šiauriniai dešinieji banginiai.