Nors vandenynas yra suskirstytas į zonas ir sluoksnius, tai yra plačios kategorijos, nenurodančios esamų ekosistemų įvairovės. Kiekvienas sluoksnis ar zona apima kelias ekosistemas, kurios prisitaikė prie specifinių buveinių, esančių tuose vandenyno regionuose. Jūrų gyvybę galima rasti nuo vešlių kranto linijų iki gilių, vandenynų apkasų.
Okeaninės zonos ir sluoksniai
Vandenynas yra padalintas į keturias pagrindines zonas: potvynio, nerito, vandenyno ir bedugnės. Potvynių zona yra pakrančių jūros zona, kuriai įtakos turi potvynio pokyčiai. Šioje zonoje yra įvairių ekosistemų, tokių kaip paplūdimiai, žiotys ir potvynių baseinai. Nerito zona yra seklus vandenynas, besitęsiantis iki žemyninio šelfo krašto, o vandenyno zona yra zona, esanti virš bedugnės lygumos. Bedugnės zona reiškia didžiules, tamsias vandenyno baseino dugno lygumas. Tai taip pat apima povandeninių kalnų grandinių vulkaninius plyšius. Nors zonos yra suskirstytos kaip vandens kolonos virš konkrečių tektoninės plokštės plotų, vandenynų sluoksniai yra padalijami pagal gylį ir šviesos režimą. Viršutinį vandenyno sluoksnį, vadinamą epipelaginiu, seka vis giliau mezopelaginis ir batipelaginis; bedugnė yra giliausias sluoksnis.
Kranto ekosistemos
Daugybė skirtingų ekosistemų ir bendruomenių klesti besikeičiančiuose vandenynų krantuose. Smėlėti paplūdimiai palaiko paukščius, vėžiagyvius ir roplius, o potvynių baseinai - laikinas prieglobstis įstrigusiems jūros gyviams ir optimalios plėšrūnų medžioklės vietos. Upių žiotyse ir pelkėse yra gėlo vandens ir jūros vandens mišinys, palaikantis įvairią organizmų bendruomenę. Šios mažesnės ekosistemos yra visos didesnės bendruomenės, gyvenančios vandenyno pakrantėje, dalis.
Koraliniai rifai
Koralų rifus formuoja negyvi ir gyvi koralai. Nors šie organizmai atrodo kaip augalai, jie iš tikrųjų yra maži gyvūnai. Kai kurie koralai yra vieniši, tačiau dauguma jų yra kolonijiniai ir sudaro didesnį koralą, pagamintą iš atskirų polipų. Negyvų koralų liekanos palaipsniui kaupiasi, kad susidarytų rifai, palaikantys įvairius jūrų gyvūnus, tokius kaip:
- žuvis
- aštuonkojai
- unguriai
- rykliai
- vėžiagyviai
Mangrovės
Ši ekosistema sukasi aplink mangrovių medžius, o tai yra taksonominė medžių ir krūmų, galinčių gyventi drėgnose, druskingose buveinėse, klasifikacija. Mangrovių ekosistemos yra ketvirtadalyje pasaulio atogrąžų krantų. Ši aplinka yra daugelio žuvų ir paukščių rūšių veisimosi vieta, ji yra įvairi specializuotų augalų rūšių.
Atviras vandenynas
Atviras vandenynas yra plati ekosistema, egzistuojanti šviesos gausiame paviršiaus sluoksnyje. Šios ekosistemos gamintojai yra fotosintetinis planktonas, kurį valgo žuvys, spinduliai ir banginiai. Daugelis plėšrūnų atvirame vandenyne minta žuvimis ir kitais plėšrūnais. Ši ekosistema palaiko didžiausią pasaulyje žinduolį - mėlynąjį banginį. Vandenyno srovės yra svarbus organizmų gyvenimo ciklo veiksnys atvirame vandenyne, iš kitų vietovių atnešdamas daug maistinių medžiagų.
Gilus vandenynas
Gilių vandenynų ekosistemose nėra šviesos ir jos priklauso nuo įdubusių liekanų ir organinių medžiagų iš viršutinių vandenyno sluoksnių. Vandenyno dugnas palaiko įvairius valymo įrenginius ir jų plėšrūnus, kurie visi gauna naudos iš organinių medžiagų, nutekančių į dugną. Naują jūros dugną formuojantys vulkaniniai plyšiai taip pat palaiko ypač specializuotą organizmų bendruomenę, kuri priklauso nuo perkaitintų, rūkančių angų žemės paviršiuje. Šios angos išmeta karštą vandenį, kuriame gausu mineralų. Chemoautotrofinės bakterijos sukuria energiją, oksiduodamos sierą iš ventiliacijos angų, ir suteikia maisto krabų ir krevečių rūšims. Vamzdžių kirminai taip pat talpina energiją iš cheminių reakcijų, kad palaikytų gyvybę, todėl saulės energija yra visiškai nereikalinga šios ekosistemos išlikimui.