Nors natūralios jėgos gali sunaikinti ar įtempti gyvūnų populiaciją, vis dažniau žmogaus veikla kelia pavojų daugeliui gyvūnų. Tiesa, kai kuriems gyvūnams ir augalams, ypač prijaukintiems, pavyzdžiui, pasėliams, gyvuliams ir naminiams gyvūnėliams, buvo naudinga ir netgi klestėjo žmogaus padarytos permainos pasaulyje. Tačiau dėl šių pokyčių kai kurioms gyvūnų populiacijoms buvo daromas didžiulis spaudimas, o kai kuriais atvejais populiacijos sumažėjo iki žymiai žemesnio lygio. Mažos populiacijos ar organizmai, kurių pasiskirstymas yra ribotas, yra ypač jautrūs veiksniams pavojus, nesvarbu, ar remiamasi įprasta šio žodžio prasme, ar pavojaus rūšies apibrėžimu, įtvirtintu federalinis įstatymas.
Buveinės praradimas
Viena svarbiausių nykstančių gyvūnų priežasčių yra buveinių nykimas. Nors buveinė gali būti prarasta dėl natūralių jėgų (klimato pokyčių, geologinių pokyčių), šiandien didžioji dalis prarastų buveinių yra dėl žmogaus veiklos. Užtvankų, greitkelių, kanalų statyba, urbanizacija ir žemės ūkis smarkiai paveikia vietinių ekosistemų gyventojus. Net kai ekosistemos dalys lieka nepažeistos, kurdamos „salas“, susidariusi buveinė gali būti per maža arba per daug išsklaidyta, kad palaikytų rūšį.
Invazinės rūšys
Invazinės rūšys yra viena iš pagrindinių biologinių priežasčių, dėl kurių gyvūnams kyla pavojus. Daugelis rūšių, atvykstančių į naują ekosistemą, yra blogai pritaikytos ir greitai miršta. Tačiau kai kurios rūšys gali išnaudoti ekosistemą kenkdamos vietiniams organizmams. Mažoms ekosistemoms, tokioms kaip salose, didelės įtakos turi invazinių rūšių introdukcija, tačiau net vietines žemyninių ir vandenynų populiacijas gali sunaikinti konkurencija ar grobis įsibrovėlis.
Išteklių per didelis išnaudojimas
Perteklinė tam tikros rūšies žuvų žvejyba yra akivaizdi ir tiesioginė priežastis, dėl kurios gyvūnui kyla pavojus. Tačiau kiti ekosistemos organizmai taip pat gali pakenkti (arba gauti naudos) dėl tam tikros rūšies per didelio eksploatavimo. Pavyzdžiui, susirūpinimas, kad Kalifornijos jūrų ūdra niokojo abalonų populiaciją, sukėlė be jokio pasirinkimo jūros ūdrų žudymą, pakeičiant biotinių konkurencijos pusiausvyrą tarp kelių organizmai. Sumažėjus jūros ūdroms, įvyko sprogimas jūrų ežių, kurios ganėsi ant rudadumblių triumų. Dumblėms išsivadavus iš dugno ir išplaunant į krantą, nuo rudadumblių miškų priklausiusiems organizmams buvo daroma didesnė įtampa.
Ligos sukėlėjai ir ligos
Prijaukintų gyvūnų plitimas taip pat išplito su jais susijusias ligas naujose pasaulio vietose. Kai kuriais atvejais šios ligos užkrėtė vietines populiacijas, kurios turėjo mažai atsparumo įsiveržiančiam patogenui. Šios ligos gali pasiekti vietinių gyventojų epidemijos lygį, sumažindamos jų skaičių.
Aplinkos tarša
Įvairių formų tarša kėlė pavojų daugeliui gyvūnų. Pesticidai ir kitos cheminės medžiagos, patekusios į ekosistemą, gali žymiai pakenkti netikslinėms rūšims. Pavyzdžiui, DDT, naudojamas kovai su uodais, ilgainiui buvo susijęs su paukščių reprodukcinio greičio sumažėjimu. Kitos taršos formos, tokios kaip terminė, šviesos ir triukšmo tarša, gali sumažinti vietinių gyvūnų populiacijų išgyvenamumą.