Patogeniškos dirvožemio bakterijos

Patogenai yra mikrobai, kurie sukelia ligas savo šeimininkams. Nors augalai dažniausiai turi bijoti dėl dirvožemyje esančių patogeninių grybų, nei dėl dirvožemyje plintančių bakterinių ligų, įvairios dirvožemyje gyvenančios patogeninės bakterijos ligas sukelia ir augaluose. Dirvožemio augalų ligų sukėlėjų rūšių yra per daug, kad jas visas būtų galima išvardyti, tačiau šie yra vieni iš svarbiausių ar dažniausiai pasitaikančių. Kelios bakterijų rūšys dirvožemyje taip pat gali pasirodyti pavojingos ar net mirtinos žmonėms.

C. botulinas yra gramteigiama bakterija (t. y. bakterija, kurios testas teigiamas pagal Gramo dažymo testą), formuojanti atsparias, patvarias sporas. Kai sporos randa tinkamas sąlygas, jos dygsta ir pradeda augti. Jie gali gaminti mirtiną baltymą, vadinamą botulino toksinu, kuris veikia žmonių ir kitų žinduolių nervų sistemą, kad blokuotų pagrindinio neuromediatoriaus, vadinamo acetilcholinu, išsiskyrimą. C. botulino sporos yra dirvožemyje ir vandenyje daugelyje pasaulio regionų. Jie yra anaerobiniai ir auga tik be deguonies; rūgštinės sąlygos slopina jų augimą. Nors C. botulinas kartais sukelia mirtinus maisto sukeltus susirgimus, vadinamus botulizmu - galingu toksinu, kurį gamina bakterija taip pat tapo naudinga paralyžiuojant žmonių raumenų audinius kaip įvairių medicinos ar kosmetikos priemonių dalis procedūras. Kai naudojamas kaip terapinis agentas, botulino toksinas yra žinomas dėl jo prekinio pavadinimo „Botox“.

E. karotovora yra labai naikinantis patogenas, sukeliantis ligas įvairiausiuose augaluose, įskaitant bulves ir daugumą kitų mėsingų daržovių. Ši gramneigiama lazdelės formos bakterija gali įsiskverbti į pasėlius lauke arba laikoma sandėlyje. E porūšis. carotovora carotovora gerai išgyvena dirvožemyje ir paviršiniuose vandenyse; jis gali augti daugelio kitų ne naminių kultūrų ar net piktžolių rūšių šaknų zonose, įsiveržti į bulves ar kitas pažeidžiamas kultūras, kai tik yra galimybė. Paprastos bulvių ligos, kurias sukelia E. karotovora apima juodąją koją, oro stiebo puvinį ir gumbų minkštą puvinį.

Streptomyces niežai yra gramteigiamos bakterijos, kurios kartu su dviem kitomis Streptomyces rūšimis (S. acidiscabies ir S. kalakutienos) gali užkrėsti bulves ir kitus šakniavaisius, tokius kaip burokėliai, ridikai, ropės, morkos ir pastarnokai. Tai neįprasta tuo, kad augdamos ląstelės suformuoja gijas, panašias į grybų, nors ir gerokai mažesnės. Gijos iš S. po to gali atsirasti niežai, kad susidarytų sporos. Bakterijos plinta įsiskverbdamos į jaunus, šviežius audinius ir patekdamos į senesnius audinius per žaizdas ar natūralias angas.

Xanthomonas yra gentis, apimanti daug svarbių augalų patogenų. Nors dirvožemyje jie ilgai neišlieka, kai kurios rūšys gali išgyventi dirvoje per žiemą ir pavasarį užkrėsti naują derlių. Kaip ir visos kitos proteobakterijos, jos yra gramneigiamos. X rūšis. campestris sukelia juodąjį puvinį įvairiausiuose augaluose ir yra bene svarbiausias genties atstovas. Ironiška, bet ta pati bakterija yra auginama komerciškai, kad būtų gaminama ksantano derva, įprastas maisto priedas.