რა არის ფერმენტ ლიგაზას ფუნქცია რეკომბინანტული დნმ-ის ფორმირებაში?

უმეტეს სამუშაოებს, რომლებიც კეთდება ცოცხალ უჯრედში, მისი ცილები ასრულებს. ერთი რამ, რაც უჯრედმა უნდა გააკეთოს არის მისი დუბლირება დნმ.

თქვენს სხეულში, მაგალითად, დნმ უკვე მილიონჯერ გამეორებულია. ცილები ასრულებენ ამ საქმეს და ერთ-ერთი მათგანია ფერმენტი, რომელსაც ეწოდება დნმ ლიგაზა. მეცნიერებმა გააცნობიერეს, რომ ლიგაზა შეიძლება სასარგებლო იყოს ლაბორატორიაში რეკომბინანტული დნმ-ის შესაქმნელად, ამიტომ მათ შეადგინეს ლიგირების ეტაპი რეკომბინანტული დნმ-ის შექმნის პროცესში.

დნმ-ის ერთი სტრიქონი შედგება თანმიმდევრობისგან აზოტოვანი ფუძეები რომ მიდიან A, T, G და C შემოკლებით. ჩვეულებრივ, დნმ გვხვდება ორმაგ ძაფში, სადაც ბაზების ერთი გრძელი მიმდევრობა ემთხვევა ბაზების სხვა თანაბრად გრძელ სტრიქონს.

ორი სტრიქონი ერთმანეთს ავსებს იმაში, რომ სადაც ერთ სტრიქონს აქვს A, მეორეს აქვს T და სადაც ერთს აქვს G, მეორეს აქვს C. A და T ემთხვევა ერთმანეთს სუსტი ქიმიური ბმით, რომელსაც ეწოდება a წყალბადის ბმა, და G და C იმავეს აკეთებენ.

საერთოდ, ორი დამატებითი ძაფები მრავალი წყალბადის კავშირის საშუალებით უერთდებიან ერთმანეთს. თითოეულ ორ ინდივიდუალურ სტრიქონს აქვს საკუთარი ბირთვული ბაზები, უფრო მჭიდრო კავშირი და კოვალენტურად დაკავშირებული შაქრისა და ფოსფატის გრძელი ჯაჭვის სახით.

თქვენ შეგიძლიათ იფიქროთ დნმ – ის ძაფზე, როგორც ერთ გრძელ ხიბლზე სამაჯურზე, რომელსაც აქვს ოთხი სხვადასხვა ტიპის ხიბლი. მომხიბვლელობა უბრალოდ ჩამოკიდებულია ძლიერი ჯაჭვით, რომელიც მათ ერთმანეთთან აკავშირებს.

დნმ-ის რეპლიკაციით აშენებს კიდევ ერთ მომხიბვლელ სამაჯურს, რომელიც ემთხვევა პირველს. სადაც არ უნდა იყოს ხიბლი პირველ სამაჯურზე, T სამაჯური ჯდება მეორე სამაჯურზე და იგივე C და G– სთვის.

მეორე სამაჯურის ხიბლი შეიძლება შეესაბამებოდეს პირველ სამაჯურს, თვითონ სამაჯურზე ყოფნის გარეშე. ანუ, მათ შეუძლიათ დაუკავშირდნენ საპირისპირო ჯაჭვს სუსტი კავშირის საშუალებით, ძლიერი ჯაჭვის გარეშე, რომლებიც მათ მეზობლებთან დააკავშირებს.

დნმ ლიგაზა ფერმენტი აფიქსირებს შაქრისა და ფოსფატის ჯაჭვის გაწყვეტის ადგილებს და აღადგენს კავშირს, აერთებს შაქრისა და ფოსფატის ჯგუფებს ძლიერ კავშირში.

რეკომბინანტული დნმ არის დნმ – ის ორმაგი ძაფის გაჭრის და სხვა ორმაგ ძაფთან შეერთების შედეგი. თითოეული ორმაგი ბოჭკო ხშირად არათანაბრად იჭრება, ერთი ძაფი მთავრდება მეორესთან შედარებით რამდენიმე ფუძით.

არსებობს დამატებითი ბაზები, რომლებიც ერთ ბოლოზეა ჩამოკიდებული, მაგალითად TTAA– ში. სხვა ორმაგ სტრიქონს აქვს დამატებითი ბაზები თანმიმდევრობით, როგორიცაა AATT. დამატებითი ბაზების ორი ნაკრები - ე.წ. "წებოვანი ბოლოები"- აიღეთ ერთმანეთი სუსტი წყალბადის ობლიგაციების საშუალებით.

კიდევ ერთხელ ფიქრობთ ხიბლის სამაჯურებზე, წარმოიდგინეთ, რომ გაქვთ ერთი ორმაგი ხიბლი სამაჯური, რომელსაც ორი ჯაჭვი უკავშირდება მხოლოდ მათი შარმის საშუალებით. თქვენ ბოლოდან იჭრით, მაგრამ ერთს ბოლოდან სხვა ხიბლს აკლდებით, ასე რომ, იქ პატარა კუდი ჰკიდია.

თქვენ იგივე გააკეთეთ სხვა ორმაგი ხიბლის სამაჯურისთვის. თუ ოთხი ხიბლი ერთმანეთს ავსებს, ორი ნაწყვეტი ერთმანეთს დაუკავშირდება, მაგრამ მხოლოდ მათი მომხიბვლელობის საშუალებით.

წინა ეტაპზე დნმ რეკომბინაცია, ორი სხვადასხვა ორჯაჭვიანი დნმ-ის მოლეკულების შესაბამისი წებოვანი ბოლოები ერთმანეთთან არის დაკავშირებული. ამასთან, ერთადერთ კავშირს ორ განყოფილებას შორის არის სუსტი ობლიგაციები. მომხიბლავი სამაჯურის მსგავსად, რომელიც მხოლოდ შესატყვისი ხიბლის საშუალებით არის დაკავშირებული, მათი დაშორება ადვილი იქნებოდა.

დნმ ლიგაზას ფერმენტი პოულობს ადგილებს, სადაც შაქარი და ფოსფატის ჯგუფები არ არის დაკავშირებული ერთმანეთთან და ეს მათ ერთმანეთთან აკავშირებს. ისევ, მომხიბლავი სამაჯურის მსგავსად, დნმ ლიგაზას შემოვლის და ბაზების ჯაჭვის შემდეგ, ახალი, გრძელი, ორჯაჭვიანი დნმ-ის მოლეკულა მჭიდროდ არის დაკავშირებული ერთმანეთთან.