როგორ გამოვთვალოთ დნმ ფრაგმენტების სიგრძე

რაც შეეხება დნმ – ის ფრაგმენტების სიგრძის გაზომვას, რომლებიც უჯრედებზე გაცილებით მცირეა, მიკრობიოლოგებს სჭირდებათ შეასრულა და ყველაზე მოსახერხებელი გელის ელექტროფორეზია. ეს მეთოდი ემყარება იმ ფაქტს, რომ დნმ – ის ფრაგმენტები იტენება და ის უფრო ძვირის ალტერნატივაა მეთოდები, როგორიცაა რენტგენის კრისტალოგრაფია, რომელიც პასუხისმგებელი იყო ორმაგი სპირალის სტრუქტურის აღმოჩენაზე დნმ-ს.

იმის გამო, რომ დნმ-ის მოლეკულები დამუხტულია, მათზე მოქმედებს ელექტრული დინება. როდესაც ისინი ნეიტრალურ ლარში მოათავსებთ და გელის გასწვრივ დენად მიაქვთ, მოლეკულები მიედინება პოზიტიური ელექტროდისკენ (ანოდი). იმის გამო, რომ სხვადასხვა ზომის დნმ-ის მოლეკულები ერთნაირ მუხტს ატარებენ, პატარა უფრო სწრაფად მოძრაობენ, ამიტომ ეს პროცესი გამოყოფს მოლეკულებს ზოლებად, რომელთა შედარებაც შესაძლებელია ცნობილი ზომის ნიმუშებთან.

ჩვეულებრივ, გელი მზადდება აგაროზისგან, პოლისაქარიდისგან, რომელიც ბუფერულ ხსნარში გაცხელებისას ქმნის ნახევრად მყარ, ოდნავ ფოროვან ლარს. ერთ ბოლოს, გელი ქმნის პატარა ჩაღრმავებებს, რომლებსაც ჭები ეწოდება, სადაც მკვლევარი დნმ-ს ნიმუშებს ათავსებს, ცნობილი სიგრძის საცნობარო ნიმუშებთან ერთად, დნმ-ის კიბედ წოდებული. კიბის ფრაგმენტების სიგრძე წინასწარ განისაზღვრა სხვა მეთოდით, მაგალითად, რენტგენის კრისტალოგრაფიით.

როდესაც გელი ჩაედინება გამტარ ხსნარში და გამოიყენება ძაბვა, ფრაგმენტები იწყებენ მიგრაციას გელის საშუალებით - ჯერ პატარები და უფრო დიდი, უფრო ნელები უკან. ისინი საბოლოოდ წარმოიქმნებიან სპექტრის მსგავს ჯგუფებად ზომის მიხედვით.

მას შემდეგ, რაც ეს მოხდება, მკვლევარი გამორთავს ენერგიას, ატარებს ლარს DVA- სავალდებულო საღებავით და იკვლევს ნიმუშებს ულტრაიისფერი სინათლის ქვეშ. კიბის მითითების გამოყენებით მკვლევარს შეუძლია დაადგინოს თითოეული ფრაგმენტის ზომა ხილულ ჯგუფში. მხოლოდ ზოლები ჩანს - ინდივიდუალური დნმ – ის ფრაგმენტები ძალიან მცირეა სანახავად.

შანსები არ არის, რომ ნიმუშის ყველა ჯგუფი წყვილდება კიბეზე, ამიტომ ამ უცნობი ფრაგმენტების ზომის დასადგენად, მეცნიერები, ჩვეულებრივ, გრაფიკზე ადგენენ. X ღერძზე არის მანძილი, რომელიც თითოეულმა ჯგუფმა გაიარა კიბეებში მილიმეტრებში, ხოლო y- ღერძზე არის თითოეული ზოლის ზომა. როდესაც წერტილები უკავშირდება მრუდით, ნებისმიერი ზოლის ზომა შეიძლება ექსტრაპოლიზაცია მოხდეს მრუდიდან, ამ ჯგუფის მიერ მილიმეტრით გავლილი მანძილის გაზომვის შემდეგ.