რატომ გამოიყენება ნატრიუმი დნმ – ის მოპოვების დროს?

დნმ - დეოქსირიბონუკლეინის მჟავა - არის მოლეკულა უჯრედის ბირთვში, რომელიც შეიცავს გენეტიკურ ინფორმაციას. დნმ-ს მოპოვება მოიცავს რიგ ნაბიჯებს უჯრედის ნაზად გასახსნელად, ბირთვული მემბრანის გასახსნელად, დნმ-ის გამოყოფა ცილებისგან და შემდეგ მისი გამონადენის ნალექის გამოწვევა. ეს ხორციელდება სხვადასხვა ქიმიკატების გამოყენებით, მემბრანის სტრუქტურის, დნმ-ისა და მისი ელექტრონეგატიურობის საფუძველზე. ნატრიუმის ქლორიდი ან ნატრიუმის შემცველი სხვა ნაერთები გამოიყენება დნმ – ის სტაბილიზაციისთვის, მას შემდეგ რაც მას ჩამოაცილებენ ცილებს და დაეხმარება ნალექებს.

დნმ-ის ძირითადი სტრუქტურა არის ნუკლეოტიდების ორი გრძელი შტრიხი, რომლებიც ერთმანეთთან შაქრის ფოსფატის ხერხემალთან არის დაკავშირებული. დნმ შემდგომი განლაგებით ხდება თავისზე გადატრიალებით და მოხვევით, სხვადასხვა ცილებთან ასოცირდება ძაფების ორგანიზება და გაუხსნა. მის მშობლიურ სახელმწიფოში, დნმ-ის ნაწილი, რომელიც ყველაზე მეტად ექვემდებარება გარემოს, არის შაქრის ფოსფატის ხერხემალი. უჯრედში ეს გარემო ძირითადად წყალია; რომელშიც იხსნება დნმ. იგი წყალში იხსნება მისი საერთო პოლარობის გამო.

"პოლარობა" არის ქიმიური ტერმინი, რომელიც აღწერს მოლეკულებს, რომლებიც შეიცავს ელექტრული მუხტების არათანაბარ განაწილებას. კორნელის სამედიცინო კოლეჯის პოლ ზუმბოს თანახმად, ყველა ნუკლეინის მჟავა პოლარულია. დნმ-ის შემთხვევაში, ხერხემლის ძალიან პოლარული ფოსფატების ჯგუფები ატარებენ უარყოფით მუხტებს. ეს თვისება წყლის ხსნადობას წარმოადგენს, რადგან წყალი ასევე პოლარულია. წყლის დადებითი მუხტები ურთიერთქმედებს დნმ-ის უარყოფით მუხტებთან და ქმნის ხსნარს. შემდგომი ტესტირების ან ვიზუალიზაციისთვის დნმ-ის დასადგენად, დნმ უნდა დაილექოს წყლით ხსნარში. მას შემდეგ, რაც წყალს აქვს შედარებით სუსტი დადებითი მუხტი, ეს მიიღწევა ხსნარში უფრო ძლიერი დადებითად დამუხტული იონის მიწოდებით. ნატრიუმი ამის შესანიშნავი კანდიდატია.

მას შემდეგ, რაც დნმ ამოიღეს უჯრედის ბირთვიდან და დაუშვეს წყალთან შერევა, ნატრიუმის იონების შეყვანა დროებით მიზიდულობას ქმნის ნატრიუმსა და ხერხემალს შორის. დნმ დროებით ანეიტრალდება და შემდეგ ადვილად ხდება მისი დაშორება წყლიდან. ამ ეტაპზე ალკოჰოლის შემოღება აიძულებს დნმ და ნატრიუმის იონებს კიდევ უფრო მჭიდროდ შეერთდნენ, რადგან ალკოჰოლი ძალზე არაპოლარულია. შეიძლება გამოყენებულ იქნას ეთანოლი ან იზოპროპილის სპირტი. მას შემდეგ, რაც დნმ გამოიყოფა წყლიდან და მჭიდროდ იქნება შეკრული ნატრიუმზე, ის გამოიყოფა ხსნარიდან სადაც იგი შეიძლება იყოს კონცენტრირებული გასაწმენდად ან ვიზუალურად მოხდეს გლუვი მინის გარშემო ნაზად ტრიალით ჯოხი

პლაზმის მემბრანისა და ბირთვული მემბრანის დაშლა ხდება უჯრედებიდან დნმ-ზე მისასვლელად, როგორც წესი, ხდება ლიპიდების მოლეკულების დასაშლელად ერთგვარი სარეცხი საშუალების შეყვანა. ლაბორატორიებში ჩვეულებრივი სარეცხი საშუალებაა SDS, ან ნატრიუმის დოდეცილ სულფატი; მაგრამ მარტივი მოპოვებისთვის შეიძლება ჭურჭლის საპნის გამოყენებაც. თუ უჯრედები მცენარეული მასალისგან არის მიღებული, უჯრედის კედლის საჭმლის მომნელებლად ჩვეულებრივ ემატება ფერმენტებიც.