ფილოგენეტიკური ხე არის ევოლუციური ურთიერთობების გრაფიკული გამოსახულება, რომელიც აჩვენებს, თუ როგორ შეიძლება ორგანიზმი დაშორდეს საერთო წინაპრისგან. ადრე ეს ხდებოდა ცოცხალი ორგანიზმებისა და ნამარხების ანატომიისა და ფიზიოლოგიის შედარების გზით, ახლა კი ჩვეულებრივ გამოიყენება გენეტიკური ინფორმაცია დნმ-ის ნუკლეოტიდების თანმიმდევრობიდან აღებული. მცირე მსგავსების მქონე ორგანიზმები შეიძლება აღმოჩენილი იქნას ფილოგენეტიკური ხის ცალკეულ “ტოტებზე” და სპეციფიკური საერთოების მქონე პირები განთავსებული იქნებიან იმავე ტოტის ”ტოტებზე”. ფილოგენეტიკური ხე არის სახეობათა გააზრებისა და ორგანიზმების ევოლუციური ცვლილებების მეთოდი.
შეარჩიეთ მოდელის ორგანიზმი ურთიერთობის შედარებისთვის. ეს შეიძლება გაკეთდეს იმ სახეობის, ჯიშის ან ნუკლეოტიდის მიმდევრობით, რომელიც წარმოადგენს ორგანიზმს. ორგანიზმის მაგალითი შეიძლება იყოს ძროხა. დანარჩენი ხე აჩვენებს თუ რამდენად მჭიდროდაა დაკავშირებული ძროხა სხვა ორგანიზმებთან გენეტიკური მახასიათებლების საფუძველზე.
აირჩიეთ გარე ჯგუფი. გარე ჯგუფი ნაკლებად მჭიდროდ დაკავშირებული ორგანიზმია ან ძალზე განსხვავებული ნუკლეოტიდების მიმდევრობა. თუ მოდელის ორგანიზმი ძროხაა, მაშინ შესაძლო ჯგუფი იქნება თევზი. რაც უფრო განსხვავებულია ორი ორგანიზმი, მით უფრო შორს იქნება ფილოგენეტიკური ხე მათი განსხვავებული ტოტის წერტილი. დრო წარმოდგენილია უძველესი თარიღით დიაგრამის ბოლოში და დღევანდელი დღე მოცემულია დიაგრამის ზედა ნაწილში. ტოტების განთავსება გვიჩვენებს დაახლოებით, როდესაც წარსულში ევოლუციურმა თვისებამ შესაძლოა შეცვალა წინაპრების ორგანიზმი სხვადასხვა სახეობად.
განსაზღვრეთ მახასიათებლების ნაკრები შედარებისთვის. მაგალითად, ”ოთხი ფეხი აქვს”, ”ღეჭავს”, ”ცოცხლად შობს” ან ”თმას ზრდის”. ნუკლეოტიდების მიმდევრობა მხოლოდ დნმ-ს ანბანური წარმოდგენები, რომლებიც განსაზღვრავს მახასიათებლებს, ამიტომ სხვა ვარიანტი იქნება: ”შეიცავს თანმიმდევრობას ATGGACACGGA. "
ორგანიზმების დაყოფა მახასიათებლების გათვალისწინებით. როდესაც ერთი ორგანიზმი არ შეიცავს სასურველ ნიშანს, ხდება ტოტი ფილოგენეტიკურ ხეში. დამახასიათებელი თვისებისთვის, რომელსაც აქვს "ოთხი ფეხი", ძროხები, ცხვარი და ირემი ერთ ტოტზე იქნებოდნენ, თევზი კი ცალკე. ჩასვით ძროხის სურათი ან თანმიმდევრობა პლაკატის დაფის ზედა კუთხეში და თევზი მოპირდაპირე კუთხეში და მათგან ორი ხაზი დახაზეთ ფურცლის ძირში, გადაკვეთს V ფორმით.
განაგრძეთ მოდელის ორგანიზმების ან ნუკლეოტიდების მიმდევრობის გამოყოფა, სანამ თითოეულ მაგალითს არ ექნება განშტოება ტოტისგან ტოტად. დამახასიათებელი ”მატყლი აქვს” ცხვარს ირმისა და ძროხისგან გამოყოფს ცალკე ტოტზე. განათავსეთ ცხვრის გამოსახულება თევზის სურათთან ახლოს და დახაზეთ ხაზი, რომელიც V ფორმაში უკავშირდება ძროხის ტოტს. დამახასიათებელი ნიშნის "ფუმფულა კუდის" გამოყენება ძროხის დემარაციას წარმოადგენს ირემისგან. ჩასვით ირმის სურათი ძროხასა და ცხვარს შორის და დახაზეთ კიდევ ერთი ხაზი V ფორმაში, რომელიც იკვეთება თევზისა და ცხვრის ხაზების ზემოთ. როდესაც თითოეულ სახეობას აქვს ერთი ტოტი, ფილოგენეტიკური ხე დასრულებულია.