მცენარეები, წყალმცენარეები და სხვადასხვა ფიტოპლანქტონი თავის უჯრედებში შეიცავს ქლოროფილს. უჯრედების მოლეკულური შემადგენლობის ეს სასიცოცხლო ნაწილი აკონტროლებს ფოტოსინთეზის პროცესს ორგანიზმში ან მცენარეში. მკვლევარები ხშირად ამოწმებენ ქლოროფილის დონეს ტბებიდან, მდინარეებიდან და ნაკადებიდან ზედაპირული წყლის ნიმუშებში, აგრეთვე მცენარეთა ცხოვრებაში. ტესტის შედეგები მიუთითებს ამჟამინდელ პირობებსა და საკვებ ნივთიერებათა დონეზე, რომლებიც გავლენას ახდენენ ნიმუშზე.
ქლოროფილის დონის გაზომვა ხელს უწყობს ორგანიზმის მდგომარეობასა და წყლის ხარისხს. ქლოროფილის მაღალი დონე, როგორც წესი, მიუთითებს იმაზე, რომ ნიმუში არის მდიდარი საკვები ნივთიერებებით, ჩვეულებრივ აზოტით და ფოსფორით. ქლოროფილების არანორმალურად დაბალი დონე მიუთითებს შესაძლო დაბინძურებაზე, სეპტიკური სისტემის გაჟონვაზე ან ჩამონადენებზე. ჩვეულებრივ, ნიმუშების შეგროვება და შედარება ხდება დროთა განმავლობაში ნიმუშის არეალში ცვლილებების დასაზვერად.
სპექტროფოტომეტრია და მაღალი ხარისხის თხევადი ქრომატოგრაფია (HPLC) ორი მეთოდია, რომლებიც გამოიყენება წყლის სინჯში ქლოროფილის რაოდენობის გასაზომად. წყალი გროვდება და გაფილტრული ხდება ქლოროფილის შემცველი ორგანიზმების გამოსაყოფად. ამ ორგანიზმების უჯრედები გახეთქილია ქლოროფილის მოსაპოვებლად. შეგროვებული ნიმუში მოთავსებულია აცეტონის ხსნარში. ნიმუში ან გაანალიზებულია სპექტროფოტომეტრიით ან HPLC მეთოდით. სპექტროფოტომეტრია გულისხმობს ქლოროფილის შთანთქმის ან ფლუორესცენტული თვისებების დათვალიერებას. ნიმუში შეიძლება გაანალიზდეს HPLC მეთოდით. ტესტირების ორი ლაბორატორიული მეთოდი იზომება ნიმუშის ფლუორესცენტული შესაძლებლობების გაზომვით. სინჯები ექვემდებარება სინათლის გარკვეულ ტალღის სიგრძეს (ჩვეულებრივ 663 და 645 ნმ), რაც ქლოროფილს რეაგირებს უფრო მაღალი ტალღის სიგრძის გამოსხივებით.
ქლოროფილის დონის შესამოწმებლად შეგიძლიათ გამოიყენოთ მრიცხველი, როგორც წესი, ცოცხალი მცენარეების. ორი LED განათება ანათებს ზედაპირზე ნიმუში, სავარაუდოდ მცენარეთა ფოთოლი. წითელ LED შუქს აქვს პიკის ტალღის სიგრძე 650 ნმ და ინფრაწითელი LED პიკს 940 ნმ. სინათლის ნაწილი შეიწოვება ქლოროფილით; დანარჩენი შთანთქავს მთელ ნიმუშს. ქლოროფილის პროპორცია ნიმუშის სხვა ზომებთან გამოითვლება მრიცხველის ფარგლებში და ნაჩვენებია როგორც თვითნებური ერთეული 0-დან 199-მდე.