გადაცემის ელექტრონული მიკროსკოპი (TEM) და დასკანერებელი ელექტრონული მიკროსკოპი (SEM) არის მიკროსკოპული მეთოდები უკიდურესად მცირე ზომის ნიმუშების სანახავად. TEM და SEM შეიძლება შედარდეს ნიმუშების მომზადების მეთოდებში და თითოეული ტექნოლოგიის გამოყენებაში.
ორივე ტიპის ელექტრონული მიკროსკოპები ბომბავს ნიმუშს ელექტრონებით. TEM განკუთვნილია ობიექტების შიგნით შესასწავლად. შეღებვა უზრუნველყოფს კონტრასტს, ხოლო ჭრა უზრუნველყოფს ულტრაწვრილ ნიმუშებს გამოსაკვლევად. TEM კარგად შეეფერება ვირუსებს, უჯრედებს და ქსოვილებს.
SEM– ის მიერ გამოკვლეულ ნიმუშებს საჭიროა გამტარ საფარი, როგორიცაა ოქრო – პალადიუმი, ნახშირბადი ან პლატინა, ჭარბი ელექტრონების შესაგროვებლად, რომლებიც ფარავს სურათს. SEM კარგად შეეფერება ისეთი ობიექტების ზედაპირს, როგორიცაა მაკრომოლეკულური აგრეგატები და ქსოვილები.
ელექტრონული იარაღი წარმოქმნის ელექტრონების ნაკადს, რომლებიც კონცენტრირებულია კონდენსატორის ობიექტივით. შედედებული სხივი და გადაცემული ელექტრონები ობიექტური ობიექტივით ფოკუსირდება ფოსფორის გამოსახულების ეკრანზე. სურათის მუქი ადგილები მიუთითებს იმაზე, რომ ნაკლები ელექტრონი გადაეცა და ეს ადგილები უფრო სქელია.
როგორც TEM– ს შემთხვევაში, ელექტრონის სხივი წარმოიქმნება და კონდენსირდება ობიექტივით. ეს არის კურსის ობიექტივი SEM– ზე. მეორე ობიექტივი ქმნის ელექტრონებს მჭიდრო, წვრილ სხივად. კოჭების ნაკრები ასახავს სხივს ტელევიზორის მსგავსად. მესამე ობიექტივი სხივს მიჰყავს ნიმუშის სასურველ მონაკვეთში. სხივი შეიძლება ცხოვრობდეს მითითებულ წერტილზე. სხივს შეუძლია მთლიანი ეგზემპლარი წამში 30-ჯერ.