არსებობს მრავალი სხვადასხვა ტიპის ეკოსისტემა. წყლის ეკოსისტემები შეადგენენ მსოფლიოს ეკოსისტემების დიდ ნაწილს და შეიძლება კლასიფიცირდნენ როგორც მტკნარი წყლის ეკოსისტემები, ასევე საზღვაო ეკოსისტემები. ნებისმიერი ტიპის ეკოსისტემის მაცხოვრებლები ადაპტირებულნი იქნებიან გადარჩენისთვის ამ ეკოსისტემის მიერ წარმოდგენილ კონკრეტულ პირობებში.
ეკოსისტემა არის საზოგადოება, რომელიც ტარდება ერთად მოცემულ სფეროში არსებულ ბიოტიკურ და აბიოტურ ფაქტორებს შორის რთული ურთიერთქმედების შედეგად. ეკოსისტემის ბიოტიკური ფაქტორებია ცოცხალი ნაწილები, როგორიცაა მცენარეები, ცხოველები, ბაქტერიები და სოკოები. აბიოტიკური ფაქტორები მოიცავს ნიადაგს, წყალს და სხვა არაცოცხალ ნივთებს, რომლებიც გარემოშია. ეკოსისტემა შეიძლება იყოს ისეთივე დიდი, როგორც უდაბნო ან ისეთივე პატარა, როგორც ტალღა. მხოლოდ იმდენი ცოცხალი არსება იქნება, რამდენიც მხარს დაუჭერს საკვების მომარაგებას. ურთიერთქმედება, როგორიცაა მტაცებელი მტაცებელი და საკვებ ქსელთან ურთიერთობა, განსაზღვრავს ეკოსისტემის პოპულაციას. თითოეულ ცოცხალ არსებას აქვს თავისი როლის შესრულება, რაც ხელს უწყობს ეკოსისტემის საერთო წარმატებასა და გადარჩენას.
ტერმინი საზღვაო აღნიშნავს ეკოსისტემას, რომელიც დაკავშირებულია ოკეანეებთან. გარემოს დაცვის სააგენტოს მონაცემებით, EPA, ზღვის ეკოსისტემები შეადგენენ მსოფლიოს ეკოსისტემების დაახლოებით 70 პროცენტს. ზღვის ეკოსისტემები უნიკალურია წყალში შეჩერებული გახსნილი ნაერთების, განსაკუთრებით მარილის გამო. მიკროსკოპული პლანქტონის მსგავსი პატარა და დიდი ვეშაპების ორგანიზმები ბინადრობენ სხვადასხვა სახის ზღვის ეკოსისტემებში. საზღვაო ეკოსისტემებში შედის ოკეანეები, ესტუარები და მარილიანი ჭაობები, მარჯნის რიფები, მანგროვების ტყეები, ლაგუნები, ზღვის ბალახის კალაპოტები და ინტერტიდალური ზონა, რომელიც გადაჭიმულია პლაჟებზე.
მტკნარი წყლის ეკოსისტემების მრავალი სახეობა არსებობს. მდინარეები, ტბები, ტბები და ნაკადულები მტკნარი წყლის ყველაზე გავრცელებული წყაროა. წყალსაცავები, ჭაობები და მიწისქვეშა წყლები ასევე განიხილება მტკნარი წყლის ეკოსისტემებად. მტკნარი წყლის ეკოსისტემები არ შეიცავს წყალში იმავე გახსნილ ნივთიერებებს, როგორც ზღვის ეკოსისტემები, ამიტომ ცხოველები და მცენარეები, რომლებიც იქ ცხოვრობენ, ვერ გადარჩებიან ზღვის ეკოსისტემებში. იმის გამო, რომ მტკნარი წყალი არ შეიცავს მარილს, ის უფრო მეტად ექვემდებარება გაყინვას და გალღობას. მტკნარი წყლის მცენარეები და ცხოველები მოერგნენ ამ პროცესის გადარჩენას. მათ ასევე აქვთ რესპირატორული სტრუქტურები, რომლებიც სპეციალურად მტკნარი წყლისთვის არის ადაპტირებული და განვითარდა რეპროდუქციული და კვების ქცევები, რაც მათ საშუალებას მისცემს წარმატებით გადარჩნენ თავიანთ გარემოში.