წყლის მცენარეები უპირატესად წყალში იზრდება. ისინი ძალიან განსხვავდება ტიპის მიხედვით, ზოგი საკმაოდ ჰგავს საერთო მიწის მცენარეებს, ზოგი კი საკმაოდ განსხვავებულია. წყლის მცენარეები მიეკუთვნება ოთხი საერთო კლასის ერთ – ერთ კატეგორიას: წყალმცენარეები, მცურავი მცენარეები, წყალქვეშ მცენარეები და აღმოცენებული მცენარეები. დაჯგუფება ხდება მათი ფესვებისა და ფოთლების პოზიციონირებაზე.
წყალმცენარეები წყლის მცენარეების უძველესი და ყველაზე გავრცელებული სახეობაა. ისინი ძირითადად ოკეანეში გვხვდება და მათ არ აქვთ ფესვები, ღეროები და ფოთლები. წყალმცენარეები ძალიან მცირეა, მაგრამ ისინი წარმოადგენენ ოკეანეების კვების ჯაჭვის საფუძველს. წყალმცენარეების მაგალითებია ლინგბია და მუშკრასი.
მცურავი მცენარეები წყლის ფსკერზე არ არის მიმაგრებული, მაგრამ მათ აქვთ ფესვები, რომლებიც წყალს შთანთქავს. მცურავი მცენარეები გვხვდება მტკნარ ან მარილიან წყალში. ამ მცენარეთა ფოთლები მყარია და რჩება ბრტყელი, რათა უფრო მეტი მზის შუქი შეიწოვოს. მცურავი მცენარეების გავრცელებული მაგალითებია სხვადასხვა სახის შროშანები (მაგალითად, წყლის შროშანი ან ბანანის შროშანი) და წყლის სუმბული.
ჩაძირული ან ჩაძირული მცენარეები წყლის ფსკერზეა დაფესული და მათი მცენარეულობის უმეტესი ნაწილი წყლის ქვეშ არის. ამ მცენარეების ფოთლები თხელი და ვიწროა. წყალში ჩაძირული მცენარეების მაგალითებია ჰიდრილები და ჭაობიანი ხავსი.
აღმოცენებული მცენარეები (აგრეთვე ცნობილი როგორც emersed) წყლის ფესვებთან არის დაკავშირებული, მაგრამ მცენარეების უმეტესობა წყლის ზემოთ აქვთ. ამ მცენარეებს მზის სხივების მუდმივი ზემოქმედება სჭირდებათ. აღმოცენებული მცენარეების მაგალითებია კვანძიანი და გადანაყარი.
