Bakteri adalah organisme kecil bersel tunggal yang bermanfaat dan berbahaya bagi manusia. Beberapa bentuk bakteri membantu kita untuk hidup, seperti yang membantu memecah makanan di usus kita. Bentuk lain, seperti bakteri yang menyebabkan Wabah Bubonic, dapat membunuh seseorang jika tidak diobati. Ada banyak jenis bakteri dan mereka bernafas menggunakan metode yang berbeda. Dua metode utama respirasi bakteri adalah respirasi aerob dan respirasi anaerob.
Bentuk bakteri yang bernafas secara aerobik membutuhkan oksigen untuk hidup. Mereka memanfaatkan oksigen sebagai bahan bakar untuk membantu membakar energi dan memberi mereka energi yang dibutuhkan untuk kehidupan. Jenis pernapasan bakteri ini adalah jenis yang sama yang digunakan manusia, oleh karena itu istilah "latihan aerobik". Produk sampingan utama dari respirasi aerobik dari bakteri adalah karbon dioksida.
Banyak jenis bakteri bernafas secara anaerobik. Dengan kata lain, mereka dapat melalui proses respirasi tanpa kehadiran oksigen. Alih-alih menggunakan oksigen untuk membantu mereka membakar energi dalam makanan mereka, jenis bakteri ini menggunakan bahan kimia alami lainnya untuk membuat reaksi kimia dan melepaskan energi yang mereka butuhkan. Bahan kimia alami yang umum digunakan termasuk nitrat, sulfat dan karbon dioksida. Respirasi anaerobik pada bakteri umumnya menciptakan banyak produk sampingan. Banyak dari produk sampingan ini dapat menjadi racun atau berbahaya bagi manusia dan termasuk etanol dan hidrogen.