Munculnya warna pada mata seseorang adalah fungsi dari pigmen yang termasuk dalam iris. Warna tertentu ditentukan oleh gen individu, membuat beberapa warna mata lebih umum daripada yang lain.
Warna mata yang paling umum di seluruh dunia adalah coklat. Jumlah melanin yang tinggi, pigmen yang juga menyebabkan rambut dan warna kulit lebih gelap, akan menyebabkan warna mata cokelat. Mata yang sangat gelap mungkin tampak hitam. Mata cokelat umum terjadi di semua ras dan di semua bagian dunia.
Warna mata yang kurang umum termasuk biru (ditemukan di antara orang-orang keturunan Eropa dengan tingkat melanin yang lebih rendah), hazel (kombinasi). hijau dan coklat), abu-abu (varian biru dicampur dengan warna lain) dan hijau (biasanya dikonsolidasikan ke orang-orang Nordik asal). Yang paling langka di antara warna-warna ini adalah hijau dengan hanya satu hingga dua persen dari semua orang yang lahir dengan mata hijau alami.
Warna mata yang paling langka termasuk kuning, ungu dan merah. Amber adalah hasil dari lipokrom pigmen kuning. Mata ungu diyakini sebagai hasil dari kurangnya pigmen yang cukup untuk mengisi seluruh mata, sehingga pembuluh darah menjadi terlihat. Merah, kemungkinan yang paling langka dari semua warna mata manusia, adalah hasil dari albinisme, di mana mata kekurangan pigmen.