Bakteri heterotrofik neutrofilik dan asidofilik merupakan mayoritas spesies bakteri. Istilah "neutrofilik" dan "asidofilik" mengacu pada tingkat pH optimum spesies bakteri - ukuran keasaman atau kebasaan suatu zat. Misalnya, cuka bertindak sebagai asam, dan soda kue sebagai basa. Skala pH berkisar dari 0 hingga 14, dengan 7, pH air murni, tepat di tengah.
Heterotrof Neutrofil
Mayoritas bakteri, neutrofil, hidup di tanah atau air dan tumbuh paling baik pada pH netral antara 6 dan 8. Jika pH bervariasi terlalu jauh di luar kisaran ini, bakteri neutrofilik tidak dapat bertahan hidup. Kebanyakan bakteri yang menyebabkan penyakit pada manusia juga heterotrof neutrofil, sangat cocok untuk bertahan hidup di dalam tubuh manusia.
Heterotrof asidofilik
Bakteri asidofilik tumbuh lebih baik pada tingkat pH yang lebih rendah, biasanya di bawah pH 6, karena mereka memiliki mekanisme biologis yang memungkinkan mereka untuk menjaga pH internal mendekati netral. Drainase asam tambang - limpasan yang sangat asam dan terkontaminasi dari area pertambangan - mengandung populasi acidophiles yang tinggi yang mengoksidasi sulfida yang ditemukan dalam bijih logam. Menurut Pusat Sumber Daya Pendidikan Sains di Carleton College, Ferroplasma acidophile yang ditemukan di saluran air asam tambang menunjukkan tingkat pH serendah nol.
Heterotrof asidofilik wajib
Acidophiles obligat membutuhkan pH rendah, di bawah 4 atau 5, untuk bertahan hidup. Membran sel asidofil obligat sebenarnya larut pada tingkat pH netral, menyebabkan kematian sel. Banyak acidophiles obligat juga thermophiles - organisme yang tumbuh paling baik pada suhu tinggi - dan umumnya ditemukan di tanah vulkanik. Thiobacillus ferrooxidans mungkin menempati urutan sebagai bakteri acidophilic pengoksidasi besi yang paling sering dipelajari.