A Földön a nap energiája hajtja a szelet; így a Neptunuszon, ahol a nap nem sokkal nagyobb, mint egy csillag, gyenge szélre számíthat. Ennek azonban pont az ellenkezője igaz. A Neptunuszban a legerősebb felszíni szel van a Naprendszerben. Az e szeleket tápláló energia nagy része maga a bolygóról származik.
Bármelyik gázóriás bolygóval összehasonlítva a Föld légköre a derű medencéje. A Jupiteren a Kis Vörös Foltban a szél eléri a 618 kilométer / órát (384 mérföld per óra), ami majdnem kétszer olyan gyors, mint a leghevesebb szárazföldi hurrikán szele. A Szaturnuszon a légkör felső szele ennél majdnem háromszor erősebben, 1800 kilométer / órás sebességgel (1118 mérföld per óra) fújhat. Ezek a szelek is hátralévő helyet foglalnak el a Neptunusz Nagy Sötét Foltja közelében lévőknél, amelyet a csillagászok 1931 kilométer / órás sebességgel számoltak.
A Jupiterhez és a Szaturnuszhoz hasonlóan a Neptunusz is több energiát termel, mint amennyit a naptól kap, és ez a bolygó magjából sugárzó energia vezérli az erős felszíni szelet. A Jupiter a keletkezéséből visszamaradt energiát sugározza, és a Szaturnusz által kisugárzott energia nagyrészt a hélium eső által előidézett súrlódás eredménye. A Neptunuszon egy metántakaró - ami üvegházhatású gáz - csapdába ejti a hőt. Ha a bolygó olyan lenne, mint az Uránusz (amelynek nincs belső energiaforrása), akkor ez a hő már régen kisugárzott volna az űrbe. Ehelyett, bár a hőmérséklet fagyos, a bolygó 2,7-szer több hőt sugároz, mint amennyit a naptól kap, ami elegendő fergeteges szeleinek vezetésére.