Az eukarióták olyan organizmusok, amelyeknek összetett sejtjei vannak, beleértve a mitokondriumokat, a sejtmagokat és más sejtrészeket. A három fő sejtcsoport a gomba, a növény és az állat. Sok gomba csak felületesen kapcsolódik a növényekhez. Lehet, hogy némileg hasonlítanak a növényekre, és sejtfalaik hasonlóak a növényi sejtfalakhoz, de van egy frenológiai fa, amely megmutatja, hogy a gombák hogyan lehetnek szorosabban rokonok az állatokkal, mint a növények. Mivel az állatok evolúciótörténetében közelebb vannak a gombákhoz, mint a növényekhez, azt lehetne mondani, hogy a gomba közelebb áll az emberi rokonsághoz, mint a salátabár zöldségéhez.
Fehérje
A gombák fehérjeszekvenciái jobban hasonlítanak az állatokra, mint a növényekre. Például a celluláris nyálkás penészfehérje inkább állati fehérjére hasonlít, mint növényi fehérjére. A gombákban található riboszómák hossza az izomhoz hasonló aminosavat mutat. Valójában számos aminosav-szekvencia létezik, amelyek hasonlóak az emlősök nehézláncú fehérjéihez. Ezen aminosavak egyike 81 százalékban azonos az emberi aminosavval.
Klorofill
A növényi cellulóz különbözik a gombás cellulóztól. Röntgensugárzáskor a növényi cellulóz kristályosabb, mint a gombás cellulóz. A gombák és az állatok sem tartalmaznak kloroblasztokat, ami azt jelenti, hogy sem gombák, sem állatok nem tudják feldolgozni a fotoszintézist. A klorofill zöldíti a növényeket és táplálja a növényeket. Ezzel szemben a gombák enzimatikus úton felszívják a bomló növényi anyagból származó tápanyagokat, az állatok pedig elfogyasztják táplálékukat.
Kitin
A gombák és az állatok egyaránt tartalmaznak kitin nevű poliszacharid molekulát, amelyet a növények nem osztanak meg. A kitin egy összetett szénhidrát, amelyet szerkezeti komponensként használnak. A gombák kitint használnak szerkezeti elemként a sejtfalakban. Az állatoknál a kitint a rovarok exoskeletonja és a puhatestűek csőrje tartalmazza. A kitin a növényi cellulózhoz hasonlóan működik, de a kitin erősebb. A gombapoliszacharidokkal végzett vizsgálatok azt mutatták, hogy nitrogéntartalmú lúg hozzáadása megsemmisítette a gombákat és ecetsavat termelt. Ezek a kémiai reakciók növényi poliszacharidokban nem fordultak elő.
A gombák nem algák
Az algák a legegyszerűbb és legprimitívebb növények. 1955-ben Dr. George W. Martin arra a következtetésre jutott, hogy a gombák olyan algákból származnak, amelyek elvesztették a klorofilt. Martin hipotézise azonban nem vette figyelembe, hogy az élet kezdetekor a légköri viszonyok eltérőek lehettek volna, mint 1955-ben. Martin azt sem vette figyelembe, hogy a nitrogénmegkötő baktériumok már a növények kifejlődése előtt is létezhettek volna, amelyek felhasználhatók lettek volna a gombák táplálékforrásaként. 1966-ban Dr. A.S. Sussman megfigyelte, hogy bár a gombák felületesen hasonlítanak az algákra, a gombáknak vannak olyan aspektusai, mint a sejtmagok és a szerveződés, amelyeket nem lehet megmagyarázni.
Sterolok
Egyes biológusok arra hivatkoztak, hogy az állati és a gombás szterinek különböznek, ezért a gombák nem lehetnek hasonlóak az állatokhoz. Az állatok koleszterint, míg a gombák ergoszterint termelnek. Alapos vizsgálat után mind a gombás, mind az állati szterolok lanoszterint, míg a zöld növényekben található fitoszterolok cikloartenolt tartalmaznak.
Saját kategória?
Talán a gombák sem növényekből származnak, sem egysejtű állatokból. Egyes biológusok szerint a gombák filogenetikailag megkülönböztethetők az összes többi eukariótától. A gombák egyedülállónak tűnnek abban a tekintetben, hogy önmagukban szükséges az EF-3 nevű transzlációs megnyúlási faktor. Vannak olyan fehérjetevékenységek, amelyek elengedhetetlenek az in vivo transzlációs megnyúláshoz.