A transzmissziós elektronmikroszkóp (TEM) és a pásztázó elektronmikroszkóp (SEM) mikroszkopikus módszer a rendkívül kicsi minták megtekintésére. A TEM és a SEM összehasonlítható a minták előkészítési módszereiben és az egyes technológiák alkalmazásában.
Mindkét típusú elektronmikroszkóp elektronokkal bombázza a mintát. A TEM alkalmas a tárgyak belső elemzésére. A festés kontrasztot, a vágás pedig ultravékony mintákat tesz lehetővé. A TEM alkalmas vírusok, sejtek és szövetek vizsgálatára.
A SEM által vizsgált mintáknak olyan vezetőképes bevonatra van szükségük, mint például arany-palládium, szén vagy platina, hogy összegyűjtsék a felesleges elektronokat, amelyek eltakarnák a képet. A SEM alkalmas olyan tárgyak felületének megtekintésére, mint a makromolekuláris aggregátumok és a szövetek.
Az elektronpisztoly elektronáramot hoz létre, amelyet egy kondenzátorlencse fókuszál. A kondenzált nyalábot és az átvitt elektronokat egy objektív lencse fókuszálja a foszfor kép képernyőn megjelenő képbe. A kép sötétebb területei azt jelzik, hogy kevesebb elektron került továbbításra, és ezek a területek vastagabbak.
A TEM-hez hasonlóan elektronlencsét hoz létre és kondenzál egy lencse. Ez egy tanfolyamlencse a SEM-en. A második lencse az elektronokat szűk, vékony nyalává formálja. Tekercskészlet a sugárzást a televízióhoz hasonlóan pásztázza. Egy harmadik lencse irányítja a fénysugarat a minta kívánt részébe. A gerenda egy meghatározott ponton tartózkodhat. A sugár másodpercenként 30-szor képes beolvasni a teljes mintadarabot.