Virágzott az élet a Costa Rica-i esőerdőkben és a tengeri környezetben (az összes növény- és állatfajból minden 20. előfordulhat Costa-ban) Rica), de a Nemzetközi Természetvédelmi és Természeti Erőforrások Veszélyeztetett Fajban is több mint 100 faj található ott lista. Az erdőirtás, az élőhelyek átalakítása és a szennyezés okozza a sok faj gyengülését.
Emlősök
Costa Ricán az egyik leggazdagabb denevérpopuláció található a világon, amely az emlősállomány feléből áll. A listán szereplő denevérfajok a nagy ragadozó spektrális denevértől a hondurasi fehér denevérig terjednek, csak körülbelül 37–47 mm hosszúak, bár mindkettő alacsony kockázatú. Olyan macskákat, mint a kis foltos macska, a Costa Rica-i puma és a közép-amerikai jaguár üldözték őket élőhelyek és a tamont, a köpenyes üvöltést és a Geoffroy pókmajmos főemlősöket jelentősen lecsökkentették. További fenyegetett emlősök közé tartozik az óriási hangyaboly, a szambari szarvas és Baird tapírja.
Madarak
Costa Ricán 894 madárfaj él, több mint az Egyesült Államokban és Kanadában együttvéve. Közülük több mint 600 állandó lakos, köztük a fenyegetett csupasz nyakú esernyőmadár, a fekete guan és a kék-arany tanager, de a madarak, mint a cerulean warbler és az elegáns csér vándorolnak. A Cocos-szigeti pinty a Cocos-szigeten lakik 360 mérföldre Costa Rica partjaitól. Darwin pintyéből az egyetlen, amely nem teljesen endemikus a Galápagos-szigeteken. A fenyegetett madarak között vannak olyan ismert fajok, mint a sas (fekete magányos sas), ara (nagy zöld ara), kolibri (mangrove kolibri) és papagáj (vörös homlokú papagáj).
Hüllők és kétéltűek
Az ötköves tüskésfarkú iguána és a keskeny hídú iszap teknős a veszélyeztetett hüllők közül néhány, de még sok más van veszélyeztetett kétéltűek, amelyek többsége béka vagy szalamandra, amelyeket jellemzően az esőerdők nagy változatossága képvisel környezetek. A maki levélbéka és Starrett treefrogja kritikusan veszélyeztetettek közé tartozik. Ugyanígy az El Empalme féreg szalamandra és a két varangyfaj: a pico blanco varangy és a tarló lábú varangy. A Monte Verde arany varangyát 1989 óta nem látták, és kihaltnak tekintik.
Hal
A veszélyeztetett fajok listáján szereplő Costa Rica-i halak többsége vagy veszélyeztetett, vagy veszélyeztetett. Ide tartozik az olajbogyó-sügér, a csendes-óceáni csikóhal és a korona cápa. Számos sugár is szerepel a listán, például a telitalálat bullseye a Csendes-óceánon és a cownose ray az Atlanti-óceánon.
Gerinctelenek
Számos veszélyeztetett árnyék van, rovarok, amelyek hasonlóak a szitakötőkhöz. Ide tartoznak a fekete hátú, hosszúkás, chiriquita, kakaó és reventazon fajok. A többi veszélyeztetett rovar közül sok knobtailed szitakötő, mint a limon, púpos, catago, vulkán, alajuela és szarvas faj. Két édesvízi rákfaj és több tengeri korall is felkerült az IUCN listájára.
Növények
Costa Ricán több mint 9000 ismert növényfaj létezik. A veszélyeztetett növények közé tartoznak a hüvelyesek családjának olyan tagjai, mint az abarema és a lancepoda, amelyek utóbbi neve lándzsaszerű gyümölcséből származik. A virágos növénynek eugenia 24 faja, a quararibea aromás növény és a a virola nemzetség két faja, amely szorosan kapcsolódik a szerecsendióhoz, és sárga virágai csípősek szag. A főbb fenyegetett nemzetségek közé tartozik a korallos, a legyező pálma cryosophila és az örökzöld vagy száraz évszakú lombhullató fa cedrela. A Costa Rica-i jatropha, a manilkara fa és a gavilán blanco fa kifejezetten veszélyeztetett növényfaj.