Struktura dvolančane DNA univerzalna je u svim živim stanicama, ali razlike se javljaju u metodama za izdvajanje genomske DNA iz životinjskih i biljnih stanica. Iako genomska DNA živi u jezgri stanica, količina i čistoća ekstrahirane DNA ovise o vrsti i veličini stanice. Primjerice, određene stanice sadrže više DNA i nečistoća od drugih. Pročitajte kako biste saznali više o razlikama u ekstrakciji DNA.
Općenito izdvajanje DNA
Ako biljne i životinjske stanice tretirate sapunicom, to će razgraditi lipide u staničnim i nuklearnim membranama. Tada će se DNA smjesa odvojiti od staničnih membrana i proteina. Dalje, možete upotrijebiti alkohol za taloženje DNA u otopini. Ovisno o količini u uzorku, DNA može biti vidljiva golim okom. Međutim, imajte na umu da ovaj jednostavan postupak ne mora nužno proizvesti DNA visoke čistoće.
Biljne i životinjske stanice
Biljne stanice razlikuju se od životinjskih zbog krutog staničnog zida i organela poput kloroplasta. Sadrže i proteine i enzime koji igraju ulogu u fotosintezi. Neke biljne stanice imaju poliploidiju, što znači da imaju više od jedne kopije svakog kromosoma po stanici. Uz to, stanični procesi koji se javljaju u biljkama, poput fotosinteze, proizvode niz sekundarnih metabolita. Životinjske stanice nemaju staničnu stijenku, ali svejedno trebaju kemikalije poput natrijevog dodecil sulfata (SDS) da ometaju staničnu membranu kako bi oslobodile genomsku DNA.
Ekstrakcija biljne DNA
Biljnu genomsku DNK teže je izdvojiti zbog stanične stijenke biljke. Možete ga ukloniti homogenizacijom ili dodavanjem celulaze za razgradnju celuloze koja čini staničnu stijenku. Uz to, metaboliti prisutni u biljnoj stanici mogu ometati ekstrakciju genomske DNA onečišćujući uzorak DNA tijekom procesa taloženja.
Ekstrakcija DNA životinja
Leukociti periferne krvi glavni su izvor genomske DNA životinja, ali je uzimanje uzoraka teško jer krv mora dolaziti izravno od životinje. Krv sadrži niz spojeva poput proteina, lipida, bijelih krvnih stanica, crvenih krvnih stanica, trombocita i plazme, koji mogu kontaminirati uzorak DNA. Međutim, primarni kontaminant životinjske DNK ekstrahirane iz uzoraka krvi je hem, koji je ne-proteinska komponenta hemoglobina.
Razlike u DNK
Razlike između biljne i životinjske DNA leže u slijedu baza u zavojnici. Spojevi pronađeni u biljnim stanicama odsutni su u životinjskim stanicama, a sekvence DNK baza to odražavaju. Također, genomska biljna DNA često je veća od životinjske. Te razlike također utječu na metode ekstrakcije, prinos i čistoću DNA.