Taksonomisti sav život na Zemlji svrstavaju u jedno od pet kraljevstava. Članovi prva četiri kraljevstva, Animalia, Plantae, Fungi i Protista, svi su eukariotski organizmi. To znači da stanice organizma, koje mogu biti jednoćelijske ili višećelijske, imaju svoj genetski materijal sadržan u jezgri. Peto kraljevstvo, Monera, sadrži sve jednostanične organizme koji nemaju pravu jezgru. Članovi kraljevstva Monera obično se nazivaju bakterijama.
Eubacteriophyta
Eubacteriophyta su prave gram-pozitivne bakterije. Gram-pozitivno znači da bi ove bakterije dale pozitivan rezultat u Gramovoj mrlji. Gram-pozitivne bakterije imaju veći sadržaj peptidoglikana od gram-negativnih, dok gram-negativne bakterije imaju veću koncentraciju lipida. Unutar ovog tipa bakterije mogu biti sferne (kokus), štapičaste (bacil) ili vadičepne (spirillum).
Cijanofita
Ova vrsta bakterija sadrži organizme koji su nekada bili poznati kao "plavo-zelene alge". Danas su uglavnom klasificirani kao cijanobakterijama, jer odsutnost jezgre jasno ukazuje na to da su usko povezane s ostalim bakterijama nego što jesu algama. Ali poput algi, cijanobakterije sadrže klorofil i sposobne su fotosintezirati. Neki znanstvenici nagađaju da su cijanobakterije preteča kloroplasta u višim organizmima fotosinteze, poput algi i biljaka.
Proteobakterije
Najraznolikiji oblik u kraljevstvu Monera, proteobakterije uključuju bakterije koje vežu dušik, a koje dušik iz zraka čine biljkama i životinjama dostupnim. Bez njih život kakav poznajemo ne bi mogao postojati. Proteobakterije uključuju i poznate E. vrsta bakterija coli i salmonele, dobro poznate po tome što su potencijalni agensi trovanja hranom.
Spirohete
Te bakterije imaju uvijen oblik, kao što im i ime govori. Treponema pallidum, bakterija unutar ovog tipa, uzrokuje sifilis u ljudi. Borrelia burgdorferi, još jedan pripadnik ove skupine, uzrokuje Lymeovu bolest. Nisu sve spirohete štetne za svoje domaćine. Neki od njih žive u probavnim tragovima termita gdje zajedno s drugim mikroorganizmima pridonose sposobnosti termita da probavi celulozu. To je korisno, barem za termite.
Klasifikacija
Vrijedno je napomenuti da postoje različite škole mišljenja u pogledu klasificiranja organizama. Ne postoji "službena" taksonomija Monera u određenom tipu. Doista, mnogi znanstvenici pretplaćeni su na sustav koji u potpunosti uklanja kraljevstvo Monera i ostala četiri kraljevstva također, zamjenjujući ovo sustavom u kojem je sav život podijeljen na tri domene. Dvije od njih sadržavale bi organizme koji su nekada bili članovi Monera, dok bi sav ostali život bio dio treće domene.