Alel je moguća kodirajuća sekvenca gena. Uobičajena zabluda ili pogrešna terminologija je da postoje geni za određene osobine. Geni kontroliraju različite osobine organizma, poput boje kose ili boje očiju, ali stvarno izražavanje neke osobine ovisi o tome koji je alel dominantan. Na primjer, gen za boju očiju u ljudi može imati alel za smeđe oči i alel za plave oči, ili alel za smeđe oči i jedan za zelene oči. Ljudi, kao i drugi oblici života koji imaju po dvije kopije svakog kromosoma, također imaju po dvije kopije svakog gena za pohranu alela.
Dvije kopije gena, po jedna na svakom kromosomu, sadrže po jedan alel. Homozigoznost se javlja kada dvije kopije gena sadrže isti alel za određeni fenotip ili izraženu osobinu. Heterozigoznost se javlja kada su dva alela različita. Fenotipovi mogu biti dominantni ili recesivni. Ako je fenotip dominantan, mora biti prisutan samo jedan od alela za njega. Ako je recesivan, oba alela moraju biti prisutna.
Prema Državnom uredu za obrazovanje u Utahu, Punnettov kvadrat može se koristiti za predviđanje vjerojatnosti da će se određeni genotip pojaviti u potomstva uzimanjem alela dva roditelja i kombiniranjem ih. Genotip će utjecati na fenotip, ovisno o tome jesu li aleli dominantni ili recesivni. Osnovni Punnettov kvadrat podijeljen je na četiri manja kvadrata. Mogući geni jednog roditelja navedeni su iznad gornja dva kvadrata, a drugi uz njega ide okomito niz lijevu stranu. Velika slova označavaju dominantne alele, a mala slova recesivne alele. Na primjer, homozigotni dominantni gen za smeđe oči napisao bi se kao BB, a heterozigotni kao Bb. Homozigotni recesivni gen napisao bi se kao bb. Uzimanjem slova uz svaki kvadrat, za križ Bb x Bb vjerojatnost BB genotipa bila bi 25 posto, Bb 50 posto i bb 25 posto. Što se tiče fenotipa, potomci imaju 75 posto šanse da imaju smeđe oči, jer su smeđe oči dominantan fenotip, navodi sciencekidsathome.com.