जीवित कोशिकाएं दो प्रमुख प्रकार की होती हैं, प्रोकैरियोट्स और यूकेरियोट्स। लगभग 2 अरब साल पहले हमारी दुनिया में केवल प्रोकैरियोट्स रहते थे। प्रोकैरियोट्स और यूकेरियोट्स के बीच मुख्य अंतर यह है कि यूकेरियोट्स में एक नाभिक होता है और प्रोकैरियोट्स में नहीं। जीव विज्ञान में, "प्रो" का अर्थ है "पहले" और "ईयू" का अर्थ है "सत्य", जबकि "कैरियोट" का अर्थ नाभिक है। जैविक साक्ष्य छोटे, सरल प्रोकैरियोट से बड़े, अधिक जटिल यूकेरियोट के विकास की ओर इशारा करते हैं।
झिल्ली
अधिकांश प्रोकैरियोट्स बैक्टीरिया हैं, जबकि मनुष्य, जानवर, पौधे और कवक यूकेरियोट्स हैं। प्रोकैरियोटिक कोशिका में केवल एक झिल्ली होती है, प्लाज्मा झिल्ली, जो इसकी कोशिकीय सामग्री को घेरे रहती है। यूकेरियोटिक कोशिका में एक प्लाज्मा झिल्ली भी होती है, लेकिन इसके अलावा, यह कई झिल्ली-संलग्न डिब्बों से भरी होती है। प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक कोशिका दोनों की झिल्लियों में एक लिपिड बाईलेयर होता है। एंडोसिम्बायोसिस सिद्धांत के अनुसार, यूकेरियोटिक कोशिका के भीतर झिल्ली संरचनाओं की उत्पत्ति को छोटी प्रोकैरियोटिक कोशिकाओं को घेरने वाली एक प्रारंभिक बड़ी प्रोकैरियोटिक कोशिका द्वारा समझाया जा सकता है।
डीएनए
प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक दोनों कोशिकाओं में डीएनए होता है, जो कोशिका के संचालन को निर्देशित करता है। प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक कोशिकाओं में समान आनुवंशिक कोड का उपयोग किया जाता है। यद्यपि एक ही प्रकार का डीएनए प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक कोशिकाओं में पाया जाता है, डीएनए नग्न होता है और एक बनाता है प्रोकैरियोट्स में लूप या सर्कल, जबकि यह रैखिक किस्में से बना होता है और प्रोटीन से ढका होता है यूकेरियोट्स।
राइबोसोम
प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक दोनों कोशिकाओं में राइबोसोम होते हैं। राइबोसोम प्रोटीन और आरएनए से बने होते हैं और दोनों प्रकार की कोशिकाओं में प्रोटीन संश्लेषण का स्थल होते हैं। प्रोटीन बनाने के लिए बिल्डिंग ब्लॉक्स अमीनो एसिड हैं। प्रोकैरियोटिक और यूकेरियोटिक कोशिकाएं प्रोटीन बनाने के लिए समान 20 अमीनो एसिड का उपयोग करती हैं, जो संबंधितता का संकेत देती हैं।
माइटोकॉन्ड्रिया और क्लोरोप्लास्ट
यूकेरियोट्स में माइटोकॉन्ड्रिया या क्लोरोप्लास्ट होते हैं। जंतु कोशिकाओं के भीतर माइटोकॉन्ड्रिया और पौधों की कोशिकाओं के भीतर क्लोरोप्लास्ट प्रोकैरियोट्स की तरह दिखते हैं। माइटोकॉन्ड्रिया और क्लोरोप्लास्ट प्रोकैरियोट्स के आकार और विशेषताओं में समान हैं। आंतरिक माइटोकॉन्ड्रियल झिल्ली की गहरी तह, जिसे क्राइस्ट कहा जाता है, प्रोकैरियोटिक कोशिका में सिलवटों के समान होती है, जिसे मेसोसोम कहा जाता है। क्राइस्टे और मेसोसोम दोनों एरोबिक सेलुलर श्वसन में कार्य करते हैं। कोशिकीय श्वसन कोशिका या जीव के लिए ऊर्जा उत्पन्न करता है। क्योंकि एरोबिक श्वसन (ऑक्सीजन का उपयोग करके) अवायवीय श्वसन (ऑक्सीजन के बिना) की तुलना में अधिक ऊर्जा उत्पन्न करता है, एंडोसिम्बायोसिस सिद्धांत रखता है कि माइटोकॉन्ड्रिया का अधिग्रहण तब हुआ जब एक अवायवीय प्रोकैरियोटिक कोशिका ने एरोबिक प्रोकैरियोट्स को घेर लिया और इसलिए एरोबिक के लाभों को प्राप्त किया श्वसन माइटोकॉन्ड्रिया की तरह क्लोरोप्लास्ट, पौधों की कोशिकाओं के लिए ऊर्जा का उत्पादन करते हैं। माइटोकॉन्ड्रिया और क्लोरोप्लास्ट दोनों का अपना गोलाकार डीएनए होता है और यह यूकेरियोटिक होस्ट सेल से स्वतंत्र रूप से कार्य कर सकता है।