क्लोनिंग वैज्ञानिक समुदाय में एक गर्म नैतिक मुद्दा है, लेकिन बैक्टीरिया हर समय खुद को क्लोन करते हैं। बाइनरी विखंडन नामक एक प्रक्रिया में, एक जीवाणु अपने आकार और आनुवंशिक सामग्री को दोगुना कर देता है, फिर दो समान कोशिकाओं का उत्पादन करने के लिए विभाजित हो जाता है।
जब यूकेरियोटिक कोशिका विभाजन, या समसूत्रण की तुलना में, द्विआधारी विखंडन एक अपेक्षाकृत सरल प्रक्रिया है। सबसे पहले, जीवाणु अपने डीएनए - आनुवंशिक सामग्री की प्रतिलिपि बनाता है, जो बैक्टीरिया में गोलाकार होता है। डीएनए एक समान सेल बनाने के लिए आवश्यक सभी जानकारी देता है। फिर डीएनए को कोशिका के विपरीत छोर पर अलग किया जाता है और कोशिका विभाजन के लिए आवश्यक प्रोटीन कोशिका के केंद्र में इकट्ठा होते हैं। जीवाणु आमतौर पर अपने इंट्रासेल्युलर तरल पदार्थ को दोगुना कर देता है, जिसे साइटोप्लाज्म भी कहा जाता है। प्रोटीन कोशिका को दो भागों में विभाजित करते हैं और अधिकांश जीवाणुओं में विभाजन को पूरा करने के लिए एक नई कोशिका भित्ति का निर्माण किया जाता है।
बैक्टीरिया के दृष्टिकोण से द्विआधारी विखंडन का लाभ यह है कि यह तेज़ और सरल है। रोग नियंत्रण और रोकथाम के दृष्टिकोण से, द्विआधारी विखंडन फायदेमंद है क्योंकि यह दवा के उत्पादन को सरल करता है। आमतौर पर जीवाणु संक्रमण के इलाज के लिए केवल एक दवा की आवश्यकता होती है क्योंकि सभी जीवाणु समान होते हैं और उसी तरह प्रतिक्रिया देंगे। दुर्भाग्य से, हालांकि, कुछ बैक्टीरिया उत्परिवर्तन के माध्यम से दवा-प्रतिरोध विकसित कर रहे हैं जो संक्रमण को इलाज के लिए और अधिक कठिन बना देता है।