का प्राथमिक उपयोग डीजल ईंधन डीजल इंजन में है। डीजल इंजन के आविष्कार का श्रेय रूडोल्फ डीजल को दिया जाता है, जिन्होंने 1892 में डीजल इंजन का पहला पेटेंट दाखिल किया था। एक इंजन को ईंधन देने के लिए मूंगफली के तेल (पेट्रोलियम उत्पाद के बजाय) का उनका उपयोग - पेरिस में 1889 प्रदर्शनी मेले में प्रदर्शित - बायोडीजल ईंधन पर पहला प्रयास माना जा सकता है। डीजल ने अपने इंजन डिजाइन को उस युग के अन्य इंजनों के विकल्प के रूप में माना जो कि बड़े उद्योग पर निर्भर किए बिना रोजमर्रा के आदमी द्वारा उपयोग किए जा सकते थे। वर्तमान में, दो प्रमुख प्रकार के डीजल ईंधन हैं: पेट्रोलियम आधारित डीजल ईंधन (कभी-कभी पेट्रोडीजल कहा जाता है), जो तेल से प्राप्त होता है; और बायोडीजल ईंधन, जैसे कार्बनिक पदार्थों का उपयोग करके बनाया गया है:
अंतिम उपयोगकर्ता तक पहुंचने वाला डीजल ईंधन कच्चे तेल के रूप में अपना जीवन शुरू करता है, जो दबाव और गर्मी के साथ संयुक्त बायोमास (सब्जी और पशु) की बड़ी, क्षयकारी मात्रा का परिणाम है। एक बार जब यह बेस ऑयल काटा जाता है, तो इसे एक रिफाइनरी में ले जाया जाता है जहां यह तीन प्रक्रियाओं से गुजरता है: पृथक्करण, रूपांतरण और शुद्धिकरण। पृथक्करण प्रक्रिया बड़े आसवन टावरों में होती है, जहां तेल अत्यधिक गर्मी के संपर्क में आता है, जिससे यह गैसों और तरल पदार्थों में अलग हो जाता है। टावर के नीचे और ऊपर के तापमान के अंतर के आधार पर उत्पाद अलग हो जाते हैं। उत्पादों में शीर्ष के पास प्रोपेन गैस, बीच में डीजल और नीचे के पास स्नेहक शामिल हैं। डीजल उत्पादन में अगला कदम रूपांतरण है, जिसमें आमतौर पर अधिक गैसोलीन, डीजल और प्रोपेन बनाने के लिए पृथक्करण प्रक्रिया से कुछ भारी तेलों के लिए उत्प्रेरक लागू करना शामिल है। प्रक्रिया में अंतिम चरण शुद्धिकरण है, और आमतौर पर उत्पादों को हाइड्रोजन और सल्फर को हटाने के लिए उत्प्रेरक को उजागर करना शामिल है।
बायोडीजल उत्पादन प्रक्रिया या तो पौधे के तेल या वसा (यह पशु वसा भी हो सकती है) से शुरू होती है जिसे बाद में अल्कोहल (मेथनॉल, आमतौर पर) और उत्प्रेरक के साथ मिश्रित किया जाता है। आम तौर पर, मिश्रण को गर्म किया जाता है, जिससे यह प्रतिक्रिया करता है, वसा को ग्लिसरीन और बायोडीजल में बदल देता है। अतिरिक्त मेथनॉल दोनों उत्पादों से हटा दिया जाता है और अक्सर पुन: उपयोग किया जाता है। ग्लिसरीन और बायोडीजल दोनों को बिक्री से पहले शुद्धिकरण से गुजरना पड़ सकता है, बाद वाले को रंग हटाने के लिए आसुत किया जा सकता है।