वर्षावन पारिस्थितिकी तंत्र पृथ्वी पर सबसे घने और विविध पशु समुदायों में से कुछ को एक घर प्रदान करते हैं। हालांकि, वर्षावनों का उनके समृद्ध संसाधनों के लिए लगातार दोहन किया जाता है। खनन और वनों की कटाई जैसी मानवीय प्रथाओं का इन आवासों पर गंभीर प्रभाव पड़ता है, जिससे जानवरों की अनगिनत प्रजातियां अपने घरों को खतरनाक दर से खो देती हैं।
पक्षियों
दक्षिण और मध्य अमेरिकी वर्षावनों के तूफान, तोते और अन्य उष्णकटिबंधीय पक्षियों की कई प्रजातियों को कटाई और वनों की कटाई के अन्य कारणों से विलुप्त होने का खतरा है। हार्पी ईगल, दुनिया भर में सबसे बड़ी ज्ञात ईगल प्रजातियों में से एक, दक्षिणी मैक्सिको से पूर्वी बोलीविया तक उष्णकटिबंधीय वर्षावन तराई में पनपती है; वनों की कटाई के साथ-साथ खनन और तेल ड्रिलिंग जैसी औद्योगिक प्रथाओं से घोंसले के शिकार स्थलों के विनाश के कारण इस पक्षी का आवास लगातार सिकुड़ रहा है। आवास के नुकसान से हजारों प्रवासी पक्षी प्रजातियों को भी खतरा है। ये प्रजातियां उत्तरी अमेरिकी गर्मियों के दौरान उत्तर की यात्रा करती हैं और सर्दियों के दौरान उष्णकटिबंधीय क्षेत्रों में वापस जाती हैं; कोई भी घर और/या नष्ट किए गए घोंसले के शिकार स्थानों को खोजने के लिए हर साल अधिक से अधिक वापसी करें।
स्तनधारियों
स्तनपायी प्रजातियों की एक विस्तृत श्रृंखला वर्षावन में अपने घरों को खो रही है, छोटे कृंतक से लेकर सबसे बड़े शिकारी तक। कई बड़े स्तनधारियों को चारा और/या शिकार करने के लिए पर्याप्त जगह की आवश्यकता होती है। जैसे-जैसे कुछ क्षेत्रों में औद्योगिक प्रथाओं की प्रगति होती है, गोरिल्ला, जगुआर और प्यूमा जैसे वर्षावन स्तनधारियों को अपर्याप्त संसाधनों के साथ खंडित आवासों तक ही सीमित रहना चाहिए। वनों की कटाई वृक्षारोपण स्तनधारियों को सबसे सीधे प्रभावित करती है (वे जो पेड़ों में रहते हैं), जैसे कि उड़ने वाली गिलहरी और फलों का बल्ला, साथ ही साथ बंदरों की कई प्रजातियाँ। पूरे समुदायों को बेघर छोड़ दिया जाता है, जिससे वे बेधड़क वातावरण के अनुकूल होने के लिए मजबूर हो जाते हैं जिसके लिए वे तैयार नहीं होते हैं।
सरीसृप और उभयचर
वनों की कटाई अधिकांश वर्षावन सरीसृपों के निवास स्थान के नुकसान का प्रमुख कारण प्रदान करती है, जबकि उभयचरों की कई प्रजातियां भी अपने घरों को खो रही हैं। तेल की ड्रिलिंग और खनन प्रथाएं जो तालाबों, नदियों और नालों को दूषित करती हैं, उन्हें अपनी अर्ध-जलीय जीवन शैली के लिए पानी के नए स्रोत खोजने के लिए मजबूर करती हैं। लुप्तप्राय और लुप्तप्राय सरीसृप और उभयचर प्रजातियों में गोल्डन टॉड, मेडागास्कर डे गेको और इगुआना, साथ ही जहर डार्ट मेंढक की कई प्रजातियां शामिल हैं, विशेष रूप से कोलंबिया की।