यू.एस. एनवायर्नमेंटल प्रोटेक्शन एजेंसी (ईपीए) के अनुसार, खारे पानी के पारिस्थितिक तंत्र "ग्रह पर सबसे बड़ी जलीय प्रणाली बनाते हैं, जो पृथ्वी की सतह के 70 प्रतिशत से अधिक को कवर करती है।" खारे पानी के पारिस्थितिक तंत्र भोजन और अन्य आर्थिक संसाधन जैसे पर्यटन प्रदान करते हैं। हाल के दशकों में दुनिया की आबादी बढ़ने और पर्यावरण की स्थिति कम होने के कारण खारे पानी के पारिस्थितिकी तंत्र तनाव में आ गए हैं।
वेटलैंड्स
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अमेरिकी भूवैज्ञानिक सर्वेक्षण के अनुसार, समुद्री आर्द्रभूमि समुद्र और तटीय भूमि के बीच "संक्रमणकालीन क्षेत्र" हैं। खारे पानी के आर्द्रभूमि पारिस्थितिक तंत्र में मैंग्रोव और दलदल शामिल हैं। आर्द्रभूमि में रहने के लिए अनुकूलित जीव पानी के बाहर अपने जीवन का हिस्सा रहते हैं और उन्हें पानी की लवणता को बदलने के चक्र के अनुकूल होना चाहिए। मैंग्रोव पेड़ तटीय समुद्री पारिस्थितिक तंत्र के लिए आवश्यक हैं। यू.एस. फिश एंड वाइल्डलाइफ सर्विस के अनुसार, मैंग्रोव कई जीवों के लिए आवास प्रदान करते हैं; पक्षियों, सरीसृपों और स्तनधारियों के लिए घोंसले के शिकार स्थल और चारागाह; हवा के टूटने के रूप में कार्य करके और अपनी जड़ों के साथ तरंग क्रिया को चकित करके बफर तूफान; और उनकी जड़ों में अवसादन और अपरद को पकड़कर पानी को छान लें। खारे पानी के दलदल समुद्र तट के साथ संरक्षित क्षेत्रों में पाए जाते हैं और मैंग्रोव आवासों के समान लाभ प्रदान करते हैं। मैंग्रोव पेड़ों के बजाय, घास के पौधे और घास खारे पानी के दलदल पर हावी हैं।
खाड़ियां
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मुहाना एक अन्य महत्वपूर्ण समुद्री पारिस्थितिकी तंत्र है जहां खारे पानी और मीठे पानी एक खारे मिश्रण बनाने के लिए मिलते हैं। नेशनल ओशनिक एंड एटमॉस्फेरिक एडमिनिस्ट्रेशन (एनओएए) के अनुसार, मुहाना "अधिक के लिए आवास प्रदान करते हैं" अमेरिकी वाणिज्यिक समुद्री पकड़ का 75 प्रतिशत, "केकड़ों, क्लैम, ऑयस्टर, झींगा और अन्य मछली प्रजातियों सहित। मुहाना पक्षियों, स्तनधारियों, सरीसृपों, उभयचरों और कीड़ों के लिए एक महत्वपूर्ण आवास प्रदान करता है, और मुहाना की वनस्पति अपवाह और अन्य प्रदूषकों को छानने में मदद करती है। हालाँकि, चूंकि अधिकांश पानी भूमि से समुद्र के मुहाने के माध्यम से बहता है, इसलिए प्रदूषण की संभावना अधिक है। प्रदूषण मुहाना के पारिस्थितिक तंत्र को कम करता है और उन मनुष्यों को प्रभावित करता है जो भोजन के लिए मुहाना पर निर्भर हैं।
मूंगे की चट्टानें
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EPA के अनुसार, "प्रवाल भित्तियाँ दुनिया के सबसे समृद्ध पारिस्थितिक तंत्रों में से हैं, जो पौधों और जानवरों की विविधता में उष्णकटिबंधीय वर्षा वनों के बाद दूसरे स्थान पर हैं।" उष्णकटिबंधीय प्रवाल भित्तियाँ उथले, गर्म पानी में होती हैं, आमतौर पर एक भूमि द्रव्यमान के तट पर या उन क्षेत्रों में जहाँ कभी द्वीप मौजूद थे। प्रवाल भित्तियाँ नाजुक पारिस्थितिक तंत्र हैं जो पानी की गुणवत्ता और आवास प्रजातियों में असंतुलन के प्रति संवेदनशील हैं। कोरल रीफ खाद्य जाले शैवाल से शुरू होते हैं, जो रीफ में ऊर्जा का प्राथमिक स्रोत हैं। मूंगे और अन्य फिल्टर फीडर प्लवक पर निर्भर करते हैं - शैवाल का एक रूप - और डिटरिटस। बड़ी रीफ प्रजातियां भोजन के स्रोत और सुरक्षा के लिए कोरल पर निर्भर करती हैं, और कोरल रीफ कई महत्वपूर्ण मछली प्रजातियों के लिए एक संरक्षित नर्सरी और हैचरी क्षेत्र प्रदान करते हैं।
खुला महासागर
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नेशनल अर्थ साइंस टीचर्स एसोसिएशन (NESTA) के अनुसार, खुला महासागर, जिसे "पेलजिक ज़ोन" कहा जाता है, सबसे बड़ा समुद्री पारिस्थितिकी तंत्र है। समुद्र तट से जितना आगे बढ़ता है, उसकी गहराई उतनी ही बढ़ती जाती है। गहरे, खुले समुद्र के पारिस्थितिक तंत्र कम पोषक तत्व प्राप्त करते हैं, कम प्रकाश और निकट-किनारे के आवासों की तुलना में ठंडे होते हैं। समुद्र की गहराई बढ़ने पर बायोमास घटता है और धाराएँ बढ़ती हैं। खुला महासागर सूक्ष्म तैरते प्लवक का घर है और निम्नलिखित के साथ बड़े समुद्री स्तनधारियों और बोनी मछली का भी समर्थन करता है अनुकूलन: सुव्यवस्थित शरीर और लंबी दूरी की तैराकी और सोनार या शिकार के लिए अच्छी दृष्टि के लिए विशेष उछाल वाली विशेषताएं काला पानी। खुले समुद्र की बड़ी मछलियाँ मनुष्यों के लिए एक महत्वपूर्ण खाद्य संसाधन हैं और इनमें टूना, स्वोर्डफ़िश और शार्क शामिल हैं।