Neutrofiiliset ja acidofiiliset heterotrofiset bakteerit muodostavat suurimman osan bakteerilajeista. Termit "neutrofiilinen" ja "acidofiilinen" viittaavat bakteerilajien optimaaliseen pH-tasoon - aineen happamuuden tai emäksisyyden mittariin. Esimerkiksi etikka mittaa hapan ja ruokasoodaa perustana. PH-asteikko vaihtelee 0: sta 14: een, keskellä 7 puhdasta vettä.
Neutrofiiliset heterotrofit
Suurin osa bakteereista, neutrofiileistä, elää maaperässä tai vedessä ja kasvaa parhaiten neutraalissa pH-arvossa 6-8. Jos pH vaihtelee liian kauas tämän alueen ulkopuolella, neutrofiiliset bakteerit eivät voi selviytyä. Useimmat bakteerit, jotka aiheuttavat ihmisillä sairauksia, ovat myös neutrofiilisiä heterotrofeja, jotka sopivat hyvin selviytymään ihmiskehossa.
Acidophilic Heterotrophs
Acidophilic-bakteerit kasvavat paremmin alemmilla pH-tasoilla, yleensä alle pH-arvon 6, koska niillä on biologiset mekanismit, joiden avulla ne voivat pitää sisäisen pH-arvonsa lähellä neutraalia. Happamien kaivojen viemäröinti - likaantunut, erittäin happama valuma kaivosalueilta - sisältää suuren joukon asidofiilejä, jotka hapettavat metallimalmeissa olevaa sulfidia. Carleton Collegessa sijaitsevan tiedekasvatuksen resurssikeskuksen mukaan happokaivojen viemäröinnissä löydetyllä acidofiilillä Ferroplasmalla oli pH-arvo niinkin alhainen.
Pakollisesti acidofiiliset heterotrofit
Pakolliset acidofiilit vaativat alhaisen pH: n, alle 4 tai 5, selviytyäkseen. Pakollisten acidofiilien solukalvo liukenee neutraaleilla pH-tasoilla aiheuttaen solukuoleman. Monet pakolliset acidofiilit ovat myös termofiilejä - organismeja, jotka kasvavat parhaiten korkeissa lämpötiloissa - ja joita esiintyy yleisesti vulkaanisissa maaperissä. Thiobacillus ferrooxidans luultavasti sijoittuu yleisimmin tutkittavaksi rautaa hapettavaksi acidophilic-bakteeriksi.