Yhdysvalloissa on vuosittain yli miljardi tapausta tavallista nuhaa. Nimestään huolimatta tavallinen kylmä ei oikeastaan ole yksi sairaus. Todellisuudessa sen aiheuttavat erilaiset virukset, joilla kaikilla on yhteisiä piirteitä, muun muassa niiden tartuttamat ruumiinosat - nenä ja kurkku. Jokaisella flunssasta vastuussa olevalla viruksella on erilainen evoluutiohistoria.
Väärinkäsitykset
Toisin kuin yleinen käsitys, on yli 200 virusta, jotka aiheuttavat flunssan. Ihmisen rinovirukset ovat ylivoimaisesti yleisimpiä, ja niissä on vähintään 99 erilaista kantaa. Koronavirukset ovat toisella sijalla, aiheuttaen noin 1/3 tavallisista vilustumisista. Metapneumovirukset ovat toisen tyyppisiä patogeenejä, jotka aiheuttavat tavallisia kylmäoireita myös ihmisillä.
Viral Evolution
Evoluutioteoria selittää kuinka rhinovirukset ja koronavirukset ovat syntyneet. Vaikka viruksia ei yleensä luokitella eläviksi organismeiksi, ne tartuttavat isäntäsolua replikoiden itseään. Prosessissa on kuitenkin usein virheitä, joten jotkut viruksista ovat mutantteja, joilla on erilainen geneettinen informaatio kuin emoviruksella. Nämä mutaatiot luovat geneettistä monimuotoisuutta populaatiossa, mikä tarkoittaa, että samasta viruksesta on olemassa erilaisia geneettisiä muunnelmia. Muilla tekijöillä, kuten rekombinaatiolla, jossa useat kannat tartuttavat saman isännän ja vaihtavat osan geneettisestä tiedostaan, on tärkeä rooli myös viruksen evoluutiossa. Sekä koronaviruksilla että rinoviruksilla on korkea virhesuhde replikaation aikana, ja ne voivat siten kehittyä nopeasti uusien kantojen muodostamiseksi.
Rhinoviruksen kehitys
Vuonna 2009 tutkijat J. Craig Venter -instituutti ja Wisconsinin yliopisto julkaisivat kaikkien 99 ihmisen rinoviruksen kannan genomit. He käyttivät tämän työn tietoja selvittääkseen eri kantojen väliset suhteet, rakentaakseen sukupuun ja yrittääkseen valaista ihmisen rinoviruksen historiaa. Vaikka aiemmin uskottiin, että ihmisen rinoviruslajeja oli kolme, nimittäin HRV-A, HRV-B ja HRV-C, vuoden 2009 tutkimuksen tiedot viittasivat neljännen, HRV-D: n olemassaoloon. Se ehdotti myös, että HRV-A- ja HRV-C-kannoilla oli yhteinen esi-isä ja ne olivat läheisessä yhteydessä HRV-B-ryhmään. HRV: t liittyvät läheisimmin ihmisen enteroviruksiin (HEV), jotka ovat viruksia, jotka ensisijaisesti infektoivat maha-suolikanavan. Tällä hetkellä uskotaan, että HRV: llä on yhteinen esi-isä HEV: n kanssa ja että HRV-B on läheisempää sukua HEV: lle kuin muille, vaikka kukin laji ei olisi erilainen.
Metapneumovirus
Metapneumovirus on toinen lajike, joka aiheuttaa kylmän oireita ihmisillä. "Journal of Virology" -lehdessä vuonna 2008 tehdyssä tutkimuksessa verrattiin metapneumovirusten genetiikkaa ihmisillä ja linnuilla ja havaittiin, että viruksen ihmisversio liittyi linnuissa esiintyviin kantoihin. Tutkimuksen analyysin tiedot viittaavat siihen, että lintuversio on saattanut siirtyä ihmisiin noin 200 vuotta sitten.
Koronaviruksen evoluutio
Koronavirusten evoluutiotutkimus on keskittynyt ensisijaisesti SARS-versioon sen laajamittaisen julkisuuden vuoksi, jonka se sai aikaan vuoden 2003 tappavan taudinpurkauksen jälkeen. Koronavirukset on jaettu kolmeen ryhmään, ja niiden evoluutiohistoria on monimutkainen. Kuten vuoden 2007 "Journal of Virology" -tutkimuksessa todettiin, on joitain todisteita siitä, että kaikki modernit koronaviruslinjat voi olla peräisin yhteiseltä esi-isältä, joka infektoi lepakot ja myöhemmin ylitti tartunnan muiden lajien, mukaan lukien ihmisille.