Bakteereja kasvatetaan Petri-maljoissa kiinteällä alustalla, joka tunnetaan nimellä bakteeri-agar, jossa muodostuu kohonneita, pyöreitä pesäkkeitä. Toisin kuin yksittäinen bakteerisolu, siirtokunta on bakteeriryhmä, joka on riittävän suuri paljaalla silmällä näkyväksi. Bakteerikasvu voidaan mitata yksinkertaisesti havainnoimalla, kuinka monta pesäkettä on läsnä; Kvantitatiivisempiin menetelmiin kuuluu kuitenkin laskukammion käyttö tai useammin elinkelpoisten levyjen laskenta. Jälkimmäistä käytetään yleisimmin, koska se tarjoaa myös laadullista tietoa, kuten erilaisten kasvuolosuhteiden vaikutukset. Koska petrimaljassa voi olla miljardeja bakteereja, mittaaminen edellyttää ensin näytteen laimentamista, jotta pesäkkeiden määrä voidaan laskea.
Lisää koeputkessa 10 mikrolitraa bakteeriviljelmää 90 mikrolitraan laimennusväliainetta. Sulje putken kansi tiukasti ja pyörrele varovasti homogeenisen seoksen saamiseksi. Nyt näyte on kymmenesosa alkuperäisestä pitoisuudestaan.
Siirrä 10 mikrolitraa tätä uutta näytettä uuteen koeputkeen, joka sisältää 90 mikrolitraa laimennusväliainetta, sekoita se uudelleen. Jälleen kerran tuloksena näytettä laimennetaan edelleen - nyt se on sadasosa alkuperäisestä pitoisuudestaan. Toista tämä useita kertoja, kunnes alkuperäinen näyte on laimennettu välillä 10
4 ja 1010 ajat. Varmista, että jokainen putki on merkitty oikealla laimennuksella, esimerkiksi 10-1, 10-2 ja niin edelleen.Annetaan 10 mikrolitraa viimeisestä täydennetystä laimennuksesta agarlevylle. Levitä bakteeriliuos levitysreunaa käyttäen koko agarlevyn pintaan. Toista tämä vielä kahdelle levylle. On myös tavallista suorittaa nämä vaiheet muilla laimennustasoilla vertailua varten. Muista merkitä levyjen pohjat. Aseta kullekin levylle kannet takaisin ja anna agar-levyjen kuivua useita minuutteja joko laboratorion penkillä liekin alla tai inkubaattorissa. Aseta levyt inkubaattoriin, joka on asetettava bakteerikannalle sopivaan lämpötilaan. Anna kasvaa 12-16 tuntia.
Pesäkkeiden pitäisi olla näkyvissä 16 tunnin kuluttua; jotkut geneettiset modifikaatiot saattavat kuitenkin vaatia kauemmin (esimerkiksi värin kehittyminen). Kun pesäkkeitä on havaittavissa, ota levyt pois ja etsi ne, joissa on 30-300 pesäkettä. Aseta pysyvä merkitsin piste petrimaljan pohjalle - agarin puolelle, ei kannelle - aina, kun siirtomaa näkyy agarin läpi. Laske kukin merkkipiste. Toista jokaiselle astialle.
Tämän kokeen lähtöviljelmässä olevien bakteerien määrän mittaamiseksi laimennus on käännettävä päinvastaiseksi laskelmissa kahdessa paikassa. Ensinnäkin, kun otit yhden mikrolitran koeputkesta laittaa petrimalja, otit kymmenesosan laimennetusta näytteestä, joten sinun on kerrottava kaikki 10: llä sen kääntämiseksi. Lisäksi, jos koeputken laimennuskerroin oli esimerkiksi 10-7, niin pesäkkeiden määrä on kerrottava 10: llä7 laimennusvaikutuksen kääntämiseksi. Poista yksinkertaisesti negatiivinen merkki eksponentista laskelmissa. Käytä kaavaa:
[Laskettujen pesäkkeiden lukumäärä] × 10 × [kuinka monta kertaa näyte on kerrottava alkuperäisen pitoisuuden saavuttamiseksi: esimerkiksi 105] = Pesäkkeitä muodostavien yksiköiden määrä (CFU) millilitrassa lähtöviljelmää. Tämä on bakteerikasvu petrimaljoissasi.